More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1042 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1058 aa  2147    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  63.95 
 
 		 1079 aa  1390    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  37.42 
 
 		 1122 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 		 1023 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  34.65 
 
 		 1081 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  34.97 
 
 		 1177 aa  598  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.33 
 
 		 1066 aa  591  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 1050 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.88 
 
 		 1181 aa  589  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1060 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.62 
 
 		 1071 aa  574  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 		 1155 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.69 
 
 		 1066 aa  571  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1079 aa  555  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  33.59 
 
 		 1036 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1008 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 1128 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  33.03 
 
 		 1071 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1161 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.68 
 
 		 1026 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1173 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  32.78 
 
 		 1148 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  32.58 
 
 		 1117 aa  509  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  32.99 
 
 		 1038 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 1124 aa  499  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 		 1114 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1039 aa  494  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 1029 aa  491  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.99 
 
 		 1037 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1006 aa  482  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 1189 aa  477  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  32.15 
 
 		 1119 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 		 1012 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  32.83 
 
 		 982 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 1164 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 1038 aa  469  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1147 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1137 aa  464  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  32.8 
 
 		 1052 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  32.59 
 
 		 1172 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 1175 aa  463  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  32.2 
 
 		 1023 aa  461  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1026 aa  455  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1027 aa  454  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 994 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1071 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  31.63 
 
 		 1202 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  31.84 
 
 		 1017 aa  449  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 986 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  32.06 
 
 		 989 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  31.85 
 
 		 1097 aa  448  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 996 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1116 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1129 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 		 1060 aa  437  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 1140 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.94 
 
 		 1132 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 1177 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 1130 aa  439  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 		 1096 aa  438  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  30.98 
 
 		 1085 aa  439  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.64 
 
 		 1002 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  30.9 
 
 		 1047 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1168 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  31.57 
 
 		 1028 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 		 1031 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 1011 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 1076 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 1000 aa  432  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1198 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 1013 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  31.94 
 
 		 996 aa  430  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1064 aa  432  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 1006 aa  427  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.05 
 
 		 1041 aa  429  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1076 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  31.34 
 
 		 1023 aa  427  1e-118  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1161 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 1019 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.66 
 
 		 1051 aa  423  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 1020 aa  426  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 1144 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  31.35 
 
 		 1062 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1192 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 1082 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  32.45 
 
 		 1106 aa  426  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.55 
 
 		 1103 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 1033 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  31.35 
 
 		 1043 aa  423  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 1025 aa  422  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.4 
 
 		 1155 aa  422  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 1034 aa  418  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1043 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1036 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1127 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1076 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1020 aa  419  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 1075 aa  414  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  30.73 
 
 		 1163 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  31.5 
 
 		 1142 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>