More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0105 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0105  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 297 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1466  diaminopimelate epimerase  41.42 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000267094 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1558  diaminopimelate epimerase  41.53 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.540975  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07270  diaminopimelate epimerase  39.22 
 
 		 317 aa  172  9e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1049  diaminopimelate epimerase  40.4 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1464  diaminopimelate epimerase  40.23 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222043  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1501  diaminopimelate epimerase  39.94 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0192882  normal  0.294941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2438  diaminopimelate epimerase  39.94 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.270073  normal  0.851316 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23090  diaminopimelate epimerase  39.62 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.107849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3841  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 279 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3514  diaminopimelate epimerase  39.46 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1623  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 293 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.195256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1439  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10580  diaminopimelate epimerase  41.64 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0816  diaminopimelate epimerase  35.81 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1404  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000282005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2235  Diaminopimelate epimerase  36.73 
 
 		 268 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40141 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1253  diaminopimelate epimerase  40.52 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1446  diaminopimelate epimerase  39.73 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.788738  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1131  diaminopimelate epimerase  39.12 
 
 		 270 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2214  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.271575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0677  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 271 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.290007  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1230  diaminopimelate epimerase  38.23 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.017842 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3982  diaminopimelate epimerase  36.81 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0054397  normal  0.0200465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2435  diaminopimelate epimerase  37.16 
 
 		 289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3281  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 273 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0128403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4570  diaminopimelate epimerase  39.18 
 
 		 271 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12739  diaminopimelate epimerase  36.95 
 
 		 289 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.142767  normal  0.397169 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3907  diaminopimelate epimerase  36.39 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.539689  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  35.06 
 
 		 292 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27640  diaminopimelate epimerase  37.93 
 
 		 277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1483  diaminopimelate epimerase  33.12 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1799  diaminopimelate epimerase  36.21 
 
 		 290 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  33.88 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3961  diaminopimelate epimerase  36.27 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.28492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  34.81 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  31.61 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2163  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3435  diaminopimelate epimerase  30.28 
 
 		 295 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2150  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0239375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2209  diaminopimelate epimerase  33.44 
 
 		 293 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0340996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  34.1 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  31.61 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  34.65 
 
 		 280 aa  105  7e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  32.6 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  29.9 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  31.6 
 
 		 334 aa  103  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  31.21 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  29.81 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  29.71 
 
 		 292 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  29.71 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  32.57 
 
 		 279 aa  102  8e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.9 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  28.23 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  29.77 
 
 		 286 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  33.01 
 
 		 278 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09711  diaminopimelate epimerase  29.07 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.646782  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  27.89 
 
 		 284 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 387 aa  99.4  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  34.38 
 
 		 289 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09731  diaminopimelate epimerase  28.75 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137092  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08761  diaminopimelate epimerase  31.72 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0472927  hitchhiker  0.000801401 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0912  diaminopimelate epimerase  28.75 
 
 		 286 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  32.68 
 
 		 299 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  31.03 
 
 		 287 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  31.33 
 
 		 292 aa  98.2  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  31.68 
 
 		 277 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0657  diaminopimelate epimerase  34.01 
 
 		 254 aa  97.8  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0095  diaminopimelate epimerase  36.1 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 289 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  29.6 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  30.65 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  29.19 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  29.19 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  31.85 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 278 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2006  diaminopimelate epimerase  31.95 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  30 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  31.89 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  29.58 
 
 		 278 aa  96.3  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  32.56 
 
 		 286 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  28.96 
 
 		 270 aa  95.9  7e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  33.69 
 
 		 309 aa  95.5  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  31.19 
 
 		 308 aa  95.5  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  31.29 
 
 		 368 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  32.25 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  29.93 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  31.02 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  32.98 
 
 		 309 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  30.5 
 
 		 278 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>