More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1997 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1997  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 764 aa  1542    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1929  type II and III secretion system protein  28.91 
 
 		 796 aa  257  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.114575  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1778  type II secretion system protein, putative  26.86 
 
 		 822 aa  244  6e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0505418  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02977  putative GSPD-related protein  27.03 
 
 		 754 aa  232  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.220061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2522  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 619 aa  223  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.417958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3884  type II and III secretion system protein  26.88 
 
 		 760 aa  215  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1469  type II and III secretion system protein  25.71 
 
 		 792 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1284  type II and III secretion system protein  28.76 
 
 		 868 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4706  putative secretion type II protein  28.27 
 
 		 734 aa  213  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.142199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3216  type II and III secretion system secretin  28.02 
 
 		 667 aa  208  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2583  type II and III secretion system protein  24.82 
 
 		 749 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1679  type II secretory pathway, component HofQ  25.48 
 
 		 767 aa  207  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0136  putative type II secretion system protein  23.8 
 
 		 779 aa  200  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2999  type II and III secretion system protein  27.42 
 
 		 870 aa  196  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000114171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1336  type II and III secretion system protein  30.25 
 
 		 653 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.474923  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2303  GSPD-like protein  26.64 
 
 		 789 aa  191  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.109724  normal  0.194773 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1859  type II and III secretion system protein  28.65 
 
 		 861 aa  189  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.765108 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2414  type II and III secretion system protein  26.41 
 
 		 657 aa  188  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2619  type II and III secretion system protein  26.16 
 
 		 662 aa  188  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1462  type II and III secretion system protein  26.59 
 
 		 769 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29100  type II and III secretion system protein  25.81 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0223781  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1439  type II secretion system protein D  26.64 
 
 		 656 aa  177  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0989759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2468  type II and III secretion system protein  25.21 
 
 		 625 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.679634  normal  0.597766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1300  type II secretion system protein D  25.12 
 
 		 667 aa  169  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.194357  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3478  type II and III secretion system protein  24.17 
 
 		 621 aa  168  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883707  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2459  type II and III secretion system protein  24.62 
 
 		 621 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2293  type II and III secretion system protein  24.17 
 
 		 621 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.932026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1438  type II and III secretion system protein  25.2 
 
 		 812 aa  164  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12402  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1987  type II and III secretion system protein  25.34 
 
 		 615 aa  157  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0115184  normal  0.227908 
 
 
-
 
NC_003296  RS00431  putative general secretion pathway GSPD-related protein  25.1 
 
 		 698 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3789  type II and III secretion system protein  25.21 
 
 		 596 aa  154  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  26.86 
 
 		 807 aa  108  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  23.36 
 
 		 740 aa  106  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  28.25 
 
 		 805 aa  105  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1043  type II and III secretion system protein  24.01 
 
 		 589 aa  102  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0150789  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  26.11 
 
 		 805 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  25.15 
 
 		 736 aa  102  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  25.53 
 
 		 881 aa  102  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  27.71 
 
 		 650 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1035  type II and III secretion system protein  24.28 
 
 		 1421 aa  101  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  30.65 
 
 		 780 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.57 
 
 		 804 aa  99  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  25.95 
 
 		 774 aa  97.8  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  27.01 
 
 		 682 aa  98.2  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  24.68 
 
 		 787 aa  97.8  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  23.95 
 
 		 781 aa  97.4  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  23.87 
 
 		 810 aa  97.4  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  24.51 
 
 		 738 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  23.51 
 
 		 781 aa  96.7  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  23.81 
 
 		 763 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  23.61 
 
 		 776 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0679  type IV pilus secretin PilQ  25.42 
 
 		 887 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0645  type II and III secretion system protein, secretin  25.42 
 
 		 882 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 829 aa  95.5  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0679  type IV pilus secretin PilQ  25.42 
 
 		 887 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.795233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1836  type II and III secretion system protein  28.79 
 
 		 494 aa  94.7  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  26.5 
 
 		 803 aa  93.6  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  30.85 
 
 		 833 aa  93.6  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  32.07 
 
 		 767 aa  92.8  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  25.41 
 
 		 803 aa  92.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  29.59 
 
 		 779 aa  91.7  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  23.28 
 
 		 752 aa  91.3  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3281  type II and III secretion system protein  24.71 
 
 		 915 aa  90.9  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  25.55 
 
 		 775 aa  90.9  8e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  29.51 
 
 		 801 aa  90.9  8e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  23.47 
 
 		 819 aa  90.1  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  25.55 
 
 		 775 aa  90.5  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  24.52 
 
 		 747 aa  90.1  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  28.07 
 
 		 784 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2028  type IV pilus biogenesis protein PilQ  20.89 
 
 		 894 aa  89.4  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  23.92 
 
 		 641 aa  89.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  30.11 
 
 		 751 aa  89.7  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  25.08 
 
 		 783 aa  89.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1473  type II and III secretion system protein  25.44 
 
 		 808 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.401194  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  24.91 
 
 		 717 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1103  type II and III secretion system protein  24.17 
 
 		 655 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00448794  hitchhiker  0.000000000241277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  25.08 
 
 		 783 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  25.5 
 
 		 457 aa  89  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1622  type II and III secretion system protein  24.49 
 
 		 673 aa  88.6  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  23.85 
 
 		 774 aa  88.2  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  26.35 
 
 		 787 aa  87.4  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  24.04 
 
 		 793 aa  87.4  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  24.68 
 
 		 793 aa  87.4  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  24.68 
 
 		 705 aa  87  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0690  type IV pilus secretin PilQ  23.72 
 
 		 893 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_002620  TC0045  type III secretion protein SctC  26.35 
 
 		 672 aa  85.9  0.000000000000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1743  type II and III secretion system protein  32.45 
 
 		 1302 aa  85.9  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  28.98 
 
 		 681 aa  85.9  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  29.59 
 
 		 733 aa  85.5  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  26.12 
 
 		 803 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  26.67 
 
 		 753 aa  85.5  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  23.72 
 
 		 710 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  28.66 
 
 		 460 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  23.16 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  23.16 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  27.43 
 
 		 720 aa  85.1  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  23.43 
 
 		 714 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  22.88 
 
 		 870 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  25.25 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>