More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1784 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  70.81 
 
 		 1380 aa  717    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  68.74 
 
 		 1356 aa  956    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  100 
 
 		 1732 aa  3367    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  83.78 
 
 		 2554 aa  1135    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  90.49 
 
 		 3295 aa  763    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  48.73 
 
 		 840 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  45.08 
 
 		 802 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  47.1 
 
 		 870 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  45.76 
 
 		 823 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.4 
 
 		 845 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  47.54 
 
 		 848 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  39 
 
 		 1094 aa  370  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  42.49 
 
 		 930 aa  367  1e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  38.77 
 
 		 2272 aa  364  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  41.56 
 
 		 1842 aa  352  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  39.84 
 
 		 575 aa  340  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  47.58 
 
 		 1882 aa  336  2e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  34.76 
 
 		 1862 aa  335  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  36.09 
 
 		 1282 aa  334  9e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  40.41 
 
 		 2036 aa  334  1e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  48.94 
 
 		 752 aa  332  3e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  41.36 
 
 		 528 aa  331  7e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  47.74 
 
 		 1300 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  67.19 
 
 		 787 aa  328  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  48.44 
 
 		 2122 aa  326  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  41.46 
 
 		 978 aa  326  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  46.41 
 
 		 859 aa  325  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.17 
 
 		 713 aa  323  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  37.52 
 
 		 1361 aa  322  6e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  46.73 
 
 		 561 aa  320  1e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1682 aa  320  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  46.39 
 
 		 675 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  46.39 
 
 		 679 aa  315  3.9999999999999997e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  47.04 
 
 		 2000 aa  315  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  38.77 
 
 		 963 aa  315  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  44.47 
 
 		 735 aa  313  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  47.44 
 
 		 1241 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.34 
 
 		 1969 aa  311  5e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  46.43 
 
 		 669 aa  311  9e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  48.36 
 
 		 460 aa  305  4.0000000000000003e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  36.16 
 
 		 1667 aa  304  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  45.88 
 
 		 685 aa  302  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  39.46 
 
 		 530 aa  299  3e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.99 
 
 		 658 aa  298  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  48.28 
 
 		 777 aa  295  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  61.31 
 
 		 910 aa  287  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.97 
 
 		 1387 aa  284  9e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  45.99 
 
 		 819 aa  281  7e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  56.55 
 
 		 1120 aa  278  7e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  53.05 
 
 		 581 aa  274  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  48.91 
 
 		 791 aa  273  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  43.01 
 
 		 861 aa  271  8e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  42.68 
 
 		 786 aa  271  8.999999999999999e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.3 
 
 		 838 aa  270  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  53.26 
 
 		 547 aa  269  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  54.55 
 
 		 551 aa  261  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  32.59 
 
 		 941 aa  258  5e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  53.75 
 
 		 615 aa  258  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  55.34 
 
 		 1236 aa  257  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.47 
 
 		 958 aa  249  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  32.81 
 
 		 1528 aa  248  8e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  73.15 
 
 		 719 aa  238  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  37.42 
 
 		 971 aa  231  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  40.16 
 
 		 869 aa  218  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  34.37 
 
 		 1667 aa  209  5e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  32.88 
 
 		 1783 aa  207  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1799  hypothetical protein  42.63 
 
 		 653 aa  206  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1798  hypothetical protein  45.05 
 
 		 682 aa  204  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1815  nitroreductase  42.8 
 
 		 349 aa  199  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1809  nitroreductase  44.18 
 
 		 344 aa  198  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  48.61 
 
 		 2552 aa  197  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  48.77 
 
 		 1095 aa  193  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  26.78 
 
 		 1606 aa  192  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  44.19 
 
 		 930 aa  191  1e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  54.75 
 
 		 560 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1813  hypothetical protein  41.94 
 
 		 670 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.543185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  44.63 
 
 		 938 aa  187  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  38.23 
 
 		 519 aa  187  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  27.55 
 
 		 952 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  54.71 
 
 		 184 aa  185  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  39.34 
 
 		 439 aa  184  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  33.08 
 
 		 1292 aa  183  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  53.49 
 
 		 644 aa  181  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1795  hypothetical protein  43.26 
 
 		 361 aa  179  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.242338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  35.68 
 
 		 1814 aa  179  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.26 
 
 		 1011 aa  175  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1785  nitroreductase  39.63 
 
 		 276 aa  172  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  45.36 
 
 		 443 aa  170  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  51.4 
 
 		 1328 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  43.12 
 
 		 929 aa  167  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0250  nitroreductase  41.92 
 
 		 320 aa  166  5.0000000000000005e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.554213  normal  0.110242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1469  Carbohydrate binding family 6  53.47 
 
 		 735 aa  163  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.16 
 
 		 2176 aa  161  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  43.67 
 
 		 1531 aa  160  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  49.43 
 
 		 816 aa  157  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  41.6 
 
 		 821 aa  156  2.9999999999999998e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  55.36 
 
 		 940 aa  156  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  28.07 
 
 		 865 aa  156  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  38.64 
 
 		 1231 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.75 
 
 		 1931 aa  152  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>