More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2442 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2442  PKD  100 
 
 
941 aa  1925    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  51.85 
 
 
963 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  45.18 
 
 
1862 aa  553  1e-156  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  45.02 
 
 
1094 aa  546  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  41.68 
 
 
1667 aa  483  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  42.22 
 
 
2272 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  39.46 
 
 
1361 aa  453  1.0000000000000001e-126  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  42.79 
 
 
1682 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  41.02 
 
 
1282 aa  438  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  40.71 
 
 
1667 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  59.56 
 
 
996 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  42.65 
 
 
1842 aa  379  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  44.36 
 
 
978 aa  368  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  39.87 
 
 
561 aa  363  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  43.66 
 
 
735 aa  361  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  31.87 
 
 
865 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  45.64 
 
 
752 aa  349  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.74 
 
 
1356 aa  345  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  33.91 
 
 
1528 aa  341  4e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  39.44 
 
 
838 aa  335  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  43.82 
 
 
1882 aa  334  4e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  37.56 
 
 
1236 aa  334  4e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  43.4 
 
 
2036 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  44.44 
 
 
2122 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  36.61 
 
 
1387 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  42.56 
 
 
2000 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  44.55 
 
 
575 aa  325  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  44.84 
 
 
528 aa  323  9.000000000000001e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  34.38 
 
 
1783 aa  321  3e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  42.15 
 
 
2554 aa  316  9.999999999999999e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  36.12 
 
 
930 aa  313  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  41.27 
 
 
530 aa  307  5.0000000000000004e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  40.76 
 
 
958 aa  297  6e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  32.11 
 
 
952 aa  292  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  44.14 
 
 
859 aa  291  5.0000000000000004e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  46.65 
 
 
669 aa  286  9e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  33.02 
 
 
1011 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  46.22 
 
 
1300 aa  283  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  45.92 
 
 
675 aa  280  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  45.11 
 
 
679 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  45.65 
 
 
713 aa  277  6e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  46.15 
 
 
1969 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  45.38 
 
 
685 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  32.26 
 
 
2176 aa  263  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  35.16 
 
 
1292 aa  261  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  43.73 
 
 
1241 aa  260  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  45.11 
 
 
658 aa  259  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  43.14 
 
 
1120 aa  259  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  41.62 
 
 
1231 aa  257  8e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  41.32 
 
 
460 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  31.97 
 
 
1814 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.52 
 
 
1606 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.7 
 
 
1620 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  32.24 
 
 
1602 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  41.79 
 
 
861 aa  227  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  44.48 
 
 
791 aa  226  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  44.74 
 
 
910 aa  223  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  42.77 
 
 
581 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  44.52 
 
 
3295 aa  222  3e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  43.49 
 
 
1732 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  48.78 
 
 
551 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  44.29 
 
 
547 aa  207  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  43.8 
 
 
615 aa  204  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  41.54 
 
 
1042 aa  204  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  43.21 
 
 
930 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  39.08 
 
 
869 aa  192  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  31.81 
 
 
1531 aa  192  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.03 
 
 
971 aa  191  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 
870 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  36.96 
 
 
519 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  37.43 
 
 
443 aa  179  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  38.27 
 
 
802 aa  177  6e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  36.25 
 
 
840 aa  177  7e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  37.01 
 
 
823 aa  172  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  34.95 
 
 
929 aa  172  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  37.99 
 
 
719 aa  170  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  39.56 
 
 
1095 aa  168  5e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  43.04 
 
 
845 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  30.04 
 
 
1987 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  53.29 
 
 
816 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  39.45 
 
 
786 aa  162  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  38 
 
 
1092 aa  161  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  39.86 
 
 
2552 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  28.63 
 
 
684 aa  157  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  45.15 
 
 
644 aa  157  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  42.8 
 
 
819 aa  157  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  29.5 
 
 
734 aa  154  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.97 
 
 
938 aa  153  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  41.45 
 
 
777 aa  151  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  31.88 
 
 
439 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  49.16 
 
 
184 aa  147  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  45.81 
 
 
560 aa  144  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  35.28 
 
 
821 aa  143  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  41.9 
 
 
500 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  41.8 
 
 
1931 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  35.53 
 
 
1189 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1019  hypothetical protein  39.29 
 
 
218 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.298297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  32.24 
 
 
1380 aa  137  8e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  40.34 
 
 
848 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  41.03 
 
 
400 aa  135  3e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>