107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4998 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 1800 aa  3465    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.86 
 
 		 1340 aa  394  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.99 
 
 		 2194 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.25 
 
 		 1222 aa  326  3e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.06 
 
 		 1225 aa  317  9.999999999999999e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.25 
 
 		 1269 aa  299  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.8 
 
 		 1269 aa  292  3e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.59 
 
 		 1661 aa  281  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.55 
 
 		 1113 aa  281  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.39 
 
 		 1118 aa  280  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  33.05 
 
 		 1029 aa  258  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.05 
 
 		 1029 aa  255  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  42.86 
 
 		 1037 aa  227  1e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  34.6 
 
 		 5899 aa  218  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4856  hypothetical protein  34.22 
 
 		 1315 aa  213  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.212334  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.91 
 
 		 889 aa  206  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.9 
 
 		 1012 aa  201  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.91 
 
 		 1009 aa  196  4e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.32 
 
 		 3396 aa  193  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  27.85 
 
 		 2305 aa  155  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.05 
 
 		 768 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.67 
 
 		 928 aa  143  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  32.95 
 
 		 2310 aa  138  7.000000000000001e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.98 
 
 		 891 aa  137  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.56 
 
 		 1829 aa  122  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.69 
 
 		 1822 aa  122  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  31.41 
 
 		 1980 aa  118  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0786  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.22 
 
 		 711 aa  118  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1240  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.47 
 
 		 717 aa  115  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.516491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.96 
 
 		 1415 aa  112  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  29.94 
 
 		 4013 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.84 
 
 		 3168 aa  111  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.16 
 
 		 5098 aa  110  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  28.74 
 
 		 1031 aa  110  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3245  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1439 aa  107  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0883783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3733  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1439 aa  106  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226773 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  31.41 
 
 		 5453 aa  99.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.82 
 
 		 1180 aa  98.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0736  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.08 
 
 		 1021 aa  95.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3077  hypothetical protein  30.7 
 
 		 755 aa  93.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0518712  normal  0.893514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  29.63 
 
 		 1716 aa  89  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3153  hypothetical protein  29.38 
 
 		 1238 aa  84  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4044  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.6 
 
 		 647 aa  83.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.25 
 
 		 1197 aa  80.1  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.68 
 
 		 2796 aa  79.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3672  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.88 
 
 		 255 aa  76.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  28.65 
 
 		 8871 aa  75.9  0.000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0642  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.05 
 
 		 2281 aa  75.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  37.95 
 
 		 786 aa  74.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  28.41 
 
 		 4848 aa  73.6  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02371  hypothetical protein  26.24 
 
 		 2127 aa  72.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3035  protease domain-containing protein  36.36 
 
 		 1053 aa  71.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.559762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0304  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1806 aa  69.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0306  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1350 aa  69.7  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0368  cadherin  39.69 
 
 		 5444 aa  69.7  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.27 
 
 		 547 aa  66.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  34.18 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  35.98 
 
 		 5171 aa  65.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  31.96 
 
 		 16311 aa  64.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  34.62 
 
 		 932 aa  64.7  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.15 
 
 		 615 aa  64.7  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  41.67 
 
 		 7149 aa  63.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  29.72 
 
 		 2251 aa  63.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0360  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.04 
 
 		 1091 aa  62.4  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.04 
 
 		 1535 aa  62  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  47.73 
 
 		 2042 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1144  hypothetical protein  42.65 
 
 		 271 aa  60.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.069789 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  35.89 
 
 		 1222 aa  61.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  38.46 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003407  putative calcium-binding outer membrane-like protein  30.72 
 
 		 2042 aa  58.9  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  33.47 
 
 		 4214 aa  58.5  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.91 
 
 		 913 aa  57  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  37.69 
 
 		 546 aa  56.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  29.55 
 
 		 2192 aa  55.8  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  27.85 
 
 		 509 aa  55.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  41.33 
 
 		 894 aa  55.5  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  27.58 
 
 		 759 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0430  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.17 
 
 		 1092 aa  54.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.784359  hitchhiker  0.00134706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0747  outer membrane adhesin like proteiin  26.79 
 
 		 1598 aa  54.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.525894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4932  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.12 
 
 		 520 aa  54.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.908823  normal  0.398469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  28.35 
 
 		 767 aa  53.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  28.96 
 
 		 817 aa  53.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.25 
 
 		 826 aa  53.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  32.79 
 
 		 2160 aa  53.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  30.17 
 
 		 2885 aa  52.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  29.95 
 
 		 501 aa  52.4  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.49 
 
 		 911 aa  52.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1710  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.71 
 
 		 399 aa  51.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.04 
 
 		 1512 aa  51.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3634  polymorphic outer membrane protein  39.13 
 
 		 655 aa  52  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  28.83 
 
 		 461 aa  51.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2808  FHA domain-containing protein  34.02 
 
 		 894 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3707  polymorphic outer membrane protein  26.76 
 
 		 518 aa  50.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000878669  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5974  cysteine-rich repeat protein  28.3 
 
 		 731 aa  50.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.681553 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3191  hypothetical protein  29.85 
 
 		 593 aa  50.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000124226  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3218  polysaccharide deacetylase  29.06 
 
 		 465 aa  49.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.578565  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  28.35 
 
 		 575 aa  49.3  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0744  CHU large protein  34.41 
 
 		 1322 aa  49.3  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.982041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1193 aa  49.3  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.67 
 
 		 2667 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>