44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4932 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4932  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  100 
 
 		 520 aa  983    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.908823  normal  0.398469 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0447  hypothetical protein  34.43 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6246  hypothetical protein  37.6 
 
 		 512 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2077  hypothetical protein  32.54 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.48 
 
 		 1037 aa  64.3  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4998  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.24 
 
 		 1800 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.329522  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2008  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  45.1 
 
 		 3168 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  37.01 
 
 		 932 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2934  hypothetical protein  27.44 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.334803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.04 
 
 		 1661 aa  61.6  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  37.61 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 		 3396 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.26 
 
 		 1009 aa  60.1  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0309  hypothetical protein  29.3 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.858216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.65 
 
 		 2194 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  43.24 
 
 		 2305 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0407  hypothetical protein  33.7 
 
 		 277 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.126059  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0174  hypothetical protein  30.47 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.023441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  42.86 
 
 		 2310 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.14 
 
 		 826 aa  53.9  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7565  hypothetical protein  27.21 
 
 		 262 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0279  cadherin domain/calx-beta domain-containing protein  38.1 
 
 		 5899 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.48 
 
 		 1180 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.82 
 
 		 1113 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.82 
 
 		 1222 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.67 
 
 		 1340 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.82 
 
 		 889 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.8 
 
 		 1012 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.82 
 
 		 1118 aa  50.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.82 
 
 		 1225 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0970  hypothetical protein  32.39 
 
 		 258 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.431239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.88 
 
 		 1269 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.97 
 
 		 768 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.25 
 
 		 1029 aa  47.4  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  37.5 
 
 		 8871 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  41.25 
 
 		 1029 aa  47.8  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  32.31 
 
 		 1031 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 1415 aa  45.8  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  38.64 
 
 		 3394 aa  46.2  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.11 
 
 		 1269 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.79 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.94079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3078  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.63 
 
 		 469 aa  44.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1242  VCBS  51.79 
 
 		 16311 aa  44.3  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  33.77 
 
 		 631 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>