237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0039 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  100 
 
 		 1955 aa  4053    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  27.78 
 
 		 1936 aa  555  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.42 
 
 		 1986 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.46 
 
 		 1986 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.5 
 
 		 1986 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.3 
 
 		 1986 aa  509  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.4 
 
 		 1986 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  27.38 
 
 		 1986 aa  506  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0010  conjugal transfer nickase/helicase TraI  26.28 
 
 		 1756 aa  412  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0549712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  27.83 
 
 		 875 aa  278  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4192  TrwC protein  28.55 
 
 		 961 aa  258  8e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135476 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1027  TrwC protein  38.1 
 
 		 1035 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.304384 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0032  hypothetical protein  40.91 
 
 		 982 aa  222  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4309  conjugal transfer nickase/helicase TraI  24.82 
 
 		 1807 aa  221  7.999999999999999e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0077  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.18 
 
 		 1428 aa  221  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2424  exonuclease V subunit alpha  28.81 
 
 		 923 aa  221  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6945  TrwC protein  28.8 
 
 		 964 aa  216  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.422553  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1820  TrwC protein  25.43 
 
 		 929 aa  215  7e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2489  TrwC protein  37.23 
 
 		 936 aa  213  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0027  putative protein traI  27.12 
 
 		 612 aa  197  2e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.483518  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1110  conjugative relaxase domain protein  26.6 
 
 		 926 aa  184  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2183  TrwC protein  31.05 
 
 		 542 aa  177  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.964158  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5159  conjugative relaxase region-like protein  33.66 
 
 		 1014 aa  171  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.734563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5223  conjugative relaxase region-like protein  35.83 
 
 		 1010 aa  170  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.260004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3904  hypothetical protein  33.54 
 
 		 1111 aa  171  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7342  conjugative relaxase domain protein  28.76 
 
 		 1486 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.113583 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3983  hypothetical protein  33.66 
 
 		 1013 aa  162  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5557  conjugative relaxase domain protein  25.91 
 
 		 1170 aa  157  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5390  conjugative relaxase domain protein  26.23 
 
 		 1665 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0651  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  33.91 
 
 		 379 aa  144  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1622  exonuclease V subunit alpha  23.41 
 
 		 1112 aa  141  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0944  conjugative relaxase domain protein  25.7 
 
 		 943 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2354  conjugative relaxase domain protein  29.75 
 
 		 1351 aa  129  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1686  putative ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) alpha subunit  29.43 
 
 		 907 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.169345  normal  0.175397 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1976  conjugative relaxase domain protein  22.89 
 
 		 919 aa  107  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7317  putative ATP-dependent exoDNAse  27.65 
 
 		 918 aa  107  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1944  conjugative relaxase domain-containing protein  34.06 
 
 		 910 aa  105  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6204  conjugative relaxase domain-containing protein  28.93 
 
 		 1087 aa  95.1  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6333  conjugative relaxase domain protein  21.62 
 
 		 870 aa  94  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1195  conjugative relaxase domain-containing protein  30.34 
 
 		 907 aa  94.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.844088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1790  TrwC relaxase  31.4 
 
 		 322 aa  92.8  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428161  normal  0.65409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4481  conjugative relaxase domain-containing protein  33.33 
 
 		 907 aa  90.5  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.569556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  26.1 
 
 		 350 aa  79.3  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3273  RecD/TraA family helicase  30.43 
 
 		 731 aa  79  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0008  helicase, RecD/TraA family  27 
 
 		 727 aa  79  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0010  helicase, RecD/TraA family  26 
 
 		 733 aa  77.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.381195  normal  0.357387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0009  RecD/TraA family helicase  26 
 
 		 733 aa  77.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0549724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0989  helicase, RecD/TraA family  33.51 
 
 		 738 aa  77.4  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1864  RecD/TraA family helicase  32.34 
 
 		 728 aa  75.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1570  conjugative relaxase domain protein  28.46 
 
 		 1093 aa  74.3  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  25.32 
 
 		 343 aa  74.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3541  RecD/TraA family helicase  28.69 
 
 		 731 aa  74.3  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6351  conjugative relaxase domain-containing protein  26.9 
 
 		 981 aa  73.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  28.42 
 
 		 346 aa  73.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0747  TrwC relaxase  30.91 
 
 		 1836 aa  72.4  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0764  helicase, RecD/TraA family  30.57 
 
 		 728 aa  72  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0607896  normal  0.527893 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1580  DNA primase catalytic core  31.8 
 
 		 1797 aa  72  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.429508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  28.72 
 
 		 350 aa  71.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9189  Dtr system oriT relaxase  27.1 
 
 		 1123 aa  70.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136231  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0847  helicase RecD/TraA  29.33 
 
 		 738 aa  70.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  24.83 
 
 		 344 aa  70.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5577  exonuclease V subunit alpha  28.19 
 
 		 944 aa  70.1  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5611  exonuclease V subunit alpha  27.41 
 
 		 945 aa  70.1  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1959  TrwC relaxase  44.23 
 
 		 1231 aa  69.7  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00119811  normal  0.0194431 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0838  RecD/TraA family helicase  32.8 
 
 		 731 aa  69.7  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8131  Dtr system oriT relaxase  26.89 
 
 		 1100 aa  69.7  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  27.3 
 
 		 351 aa  69.3  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  26.44 
 
 		 348 aa  68.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  27.34 
 
 		 342 aa  68.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4977  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.67 
 
 		 1098 aa  68.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  68.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1425  helicase, RecD/TraA family  30.77 
 
 		 737 aa  68.6  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  24.25 
 
 		 346 aa  67.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5511  exonuclease V subunit alpha  27.35 
 
 		 946 aa  67.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.280452  hitchhiker  0.00000429446 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0079  protein TraI  31.25 
 
 		 432 aa  67  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.342651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5396  TrwC relaxase  29.51 
 
 		 1623 aa  67.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.348117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0442  conjugal transfer relaxase TraA  25.6 
 
 		 985 aa  67.4  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.692664  normal  0.757094 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6557  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  28.32 
 
 		 1095 aa  67.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  29.96 
 
 		 348 aa  67  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  29.44 
 
 		 347 aa  67  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0947  helicase, RecD/TraA family  31.29 
 
 		 740 aa  66.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5543  RecD/TraA family helicase  30.3 
 
 		 744 aa  66.6  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6810  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.73 
 
 		 1098 aa  66.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  26.29 
 
 		 344 aa  66.2  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0995  helicase RecD/TraA  32.26 
 
 		 727 aa  66.6  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0231069  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1462  helicase RecD/TraA  32.52 
 
 		 739 aa  66.6  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5319  helicase, RecD/TraA family  29.09 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.481799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3575  Dtr system oriT relaxase  28.57 
 
 		 1102 aa  65.9  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  24.92 
 
 		 351 aa  65.9  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5393  Dtr system oriT relaxase  24.57 
 
 		 1102 aa  65.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.763258  normal  0.706362 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0849  TrwC relaxase  29.44 
 
 		 1175 aa  65.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  23.18 
 
 		 348 aa  64.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5514  Dtr system oriT relaxase  30.6 
 
 		 1107 aa  64.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0765264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2250  DNA primase catalytic core  31.22 
 
 		 1976 aa  64.7  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6240  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  22.83 
 
 		 1102 aa  64.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294548  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0682  Ti-type conjugative transfer relaxase TraA  23.63 
 
 		 1105 aa  63.9  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0435  conjugal transfer relaxase TraA  23.65 
 
 		 968 aa  63.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.441479 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0826  helicase RecD/TraA  31.35 
 
 		 726 aa  63.2  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0149  conjugal transfer relaxase TraA  24.58 
 
 		 1034 aa  63.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  25.68 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>