86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3335 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  67.52 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  63.17 
 
 		 354 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  64.57 
 
 		 353 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  62.82 
 
 		 342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  64.57 
 
 		 353 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  63.22 
 
 		 353 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  62.29 
 
 		 343 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  60.86 
 
 		 348 aa  390  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  63.58 
 
 		 351 aa  388  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  63.11 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  59.03 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  59.65 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  63.37 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  60.23 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  60.23 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  62.43 
 
 		 350 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  61.96 
 
 		 345 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  60.63 
 
 		 346 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  59.89 
 
 		 345 aa  364  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  59.38 
 
 		 345 aa  361  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  58.91 
 
 		 347 aa  351  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  57.93 
 
 		 345 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  56.78 
 
 		 348 aa  347  1e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  58.64 
 
 		 346 aa  339  5e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  55.81 
 
 		 350 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  53.87 
 
 		 345 aa  325  6e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  54.52 
 
 		 348 aa  325  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  54.96 
 
 		 344 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  61.03 
 
 		 276 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  54.26 
 
 		 344 aa  311  9e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  51.59 
 
 		 348 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  51.87 
 
 		 357 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  47.85 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  37.69 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  34.52 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  31.98 
 
 		 309 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  33.65 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  35.56 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  31.63 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  34.72 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  34.72 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  27.95 
 
 		 575 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  43.68 
 
 		 610 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  40 
 
 		 597 aa  66.2  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1955 aa  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  32.76 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  29.23 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  33.52 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  29.51 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  28.63 
 
 		 401 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  32.78 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  31.86 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  32.54 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  29.47 
 
 		 359 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  33.59 
 
 		 788 aa  57.8  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  28.33 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  32.98 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  31.58 
 
 		 610 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  30.77 
 
 		 716 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  23.78 
 
 		 371 aa  53.1  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  30.77 
 
 		 712 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  30.77 
 
 		 712 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  30.77 
 
 		 712 aa  53.1  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  30.77 
 
 		 720 aa  52.8  0.000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  31.44 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  31.22 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  34.31 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  27.75 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  34.96 
 
 		 665 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  29.81 
 
 		 712 aa  50.4  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  26.28 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.06 
 
 		 1986 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.06 
 
 		 1986 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0613  putative DNA primase  33.08 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2197  Exonuclease III-like protein  56 
 
 		 126 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  30.5 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.06 
 
 		 1986 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  24.06 
 
 		 1986 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.68 
 
 		 1986 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.68 
 
 		 1986 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  36.36 
 
 		 759 aa  46.6  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  34.25 
 
 		 731 aa  46.6  0.0007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  40.98 
 
 		 755 aa  44.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  27.47 
 
 		 682 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>