85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4156 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  686    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  63.37 
 
 		 344 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  59.54 
 
 		 344 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  57.93 
 
 		 351 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  57.65 
 
 		 343 aa  345  4e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  57.06 
 
 		 342 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  56.25 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  56.25 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  54.76 
 
 		 346 aa  328  8e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  55.56 
 
 		 348 aa  326  3e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  55.16 
 
 		 344 aa  322  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  57.56 
 
 		 354 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  57.1 
 
 		 353 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  55.59 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  55.69 
 
 		 354 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  56.36 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  55.65 
 
 		 346 aa  310  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  54.49 
 
 		 345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  54.39 
 
 		 353 aa  309  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  54.41 
 
 		 347 aa  309  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  55.85 
 
 		 351 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  53.67 
 
 		 347 aa  308  8e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  55 
 
 		 346 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  53.8 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  52.33 
 
 		 345 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  50.87 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  51.01 
 
 		 350 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  49.28 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  48.41 
 
 		 345 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  53.67 
 
 		 346 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  49.26 
 
 		 352 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  50.29 
 
 		 357 aa  256  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  47.93 
 
 		 348 aa  250  2e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  52.21 
 
 		 276 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  33.94 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  34.51 
 
 		 328 aa  79  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  33.77 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  30.17 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  32.69 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0039  hypothetical protein  25 
 
 		 1955 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.401794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  32.94 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  26.85 
 
 		 339 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  34.73 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  32.64 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.23 
 
 		 321 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  31.98 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  25.47 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  30.1 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  29.25 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  29.92 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  27.36 
 
 		 575 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.09 
 
 		 1986 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  35.58 
 
 		 597 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  25 
 
 		 1986 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.09 
 
 		 1986 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  26.09 
 
 		 1986 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  31.31 
 
 		 298 aa  53.9  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  30.15 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  30.29 
 
 		 320 aa  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.54 
 
 		 1986 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  29.82 
 
 		 280 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  38.55 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  25.54 
 
 		 1986 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  32.04 
 
 		 788 aa  51.6  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  33.62 
 
 		 716 aa  50.8  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0613  putative DNA primase  29.07 
 
 		 401 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  29.21 
 
 		 312 aa  50.1  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  34.62 
 
 		 712 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  34.62 
 
 		 712 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  34.62 
 
 		 712 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  34.62 
 
 		 720 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  32.27 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  33.65 
 
 		 712 aa  47.8  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  31.36 
 
 		 665 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  32.98 
 
 		 1936 aa  47  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  30.62 
 
 		 309 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  24.4 
 
 		 610 aa  46.2  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  24 
 
 		 682 aa  45.1  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  28.38 
 
 		 765 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  24.71 
 
 		 875 aa  43.5  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2197  Exonuclease III-like protein  52.94 
 
 		 126 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1967  hypothetical protein  27.03 
 
 		 942 aa  42.7  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>