66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4199 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  695    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  39.65 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  36.36 
 
 		 575 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  28.93 
 
 		 359 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  30.25 
 
 		 401 aa  109  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  36.14 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  37.28 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  34.8 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  36.22 
 
 		 296 aa  90.5  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  31.7 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  31.25 
 
 		 220 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  28.17 
 
 		 355 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  31.44 
 
 		 371 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  33.49 
 
 		 328 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  29.25 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  32.81 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  32.81 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  31.1 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  32.58 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  31.18 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  28.52 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  31.05 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  30.05 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  28.19 
 
 		 355 aa  69.3  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  29.53 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  27.76 
 
 		 341 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  31.68 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  32.02 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  29.76 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  26.85 
 
 		 345 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  29.51 
 
 		 351 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  27.06 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  28 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  29.57 
 
 		 345 aa  63.2  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  30.05 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.81 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  29.56 
 
 		 353 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  26.81 
 
 		 358 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  38.24 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  27.32 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  29.59 
 
 		 348 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  30.81 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  29.8 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  32.2 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  32.2 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  28.02 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  30.81 
 
 		 346 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  31.58 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  27.98 
 
 		 348 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  24.81 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  31.64 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  26.42 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  31.86 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  31.64 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  35.77 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  27.93 
 
 		 344 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  31.09 
 
 		 280 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  30.56 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  25.87 
 
 		 361 aa  53.1  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  29.68 
 
 		 665 aa  50.4  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  26.92 
 
 		 354 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  29.21 
 
 		 346 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3226  aldehyde dehydrogenase  27.88 
 
 		 1681 aa  47.8  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  29.34 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>