76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2117 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  100 
 
 		 610 aa  1266    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  44.97 
 
 		 610 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  45.38 
 
 		 597 aa  518  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  41.44 
 
 		 788 aa  321  3e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  36.2 
 
 		 342 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1933  hypothetical protein  38.33 
 
 		 323 aa  193  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262327  hitchhiker  0.000000452368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  26.63 
 
 		 607 aa  124  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  25.15 
 
 		 601 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  24.5 
 
 		 592 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  25 
 
 		 646 aa  98.6  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  27.1 
 
 		 531 aa  95.9  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  23.83 
 
 		 544 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  27.18 
 
 		 716 aa  83.6  0.000000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  27.27 
 
 		 712 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  27.27 
 
 		 712 aa  80.5  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  27.27 
 
 		 712 aa  80.5  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  27.27 
 
 		 720 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  26.99 
 
 		 712 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  49.3 
 
 		 731 aa  78.2  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  34.06 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  42.15 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  34.88 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  30.94 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  35.87 
 
 		 682 aa  70.1  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  37.61 
 
 		 348 aa  70.1  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  25.39 
 
 		 738 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  34.21 
 
 		 353 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  38.83 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  37.96 
 
 		 350 aa  67  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  27.06 
 
 		 759 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  43.68 
 
 		 351 aa  67  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  39.22 
 
 		 348 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  47.3 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  24.6 
 
 		 515 aa  65.1  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  37.23 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  30.08 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  35.92 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  27.76 
 
 		 346 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  40.45 
 
 		 892 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  32.59 
 
 		 354 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  34.65 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  37.74 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  37.63 
 
 		 345 aa  62.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  46.48 
 
 		 755 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  44.59 
 
 		 354 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  37.62 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  37.63 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  34.95 
 
 		 346 aa  61.6  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  37.62 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  24.27 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  42.47 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  32.12 
 
 		 342 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  32.14 
 
 		 351 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.98 
 
 		 347 aa  56.6  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 346 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  25.58 
 
 		 765 aa  54.7  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  41.03 
 
 		 346 aa  54.3  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  40.85 
 
 		 353 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  26.41 
 
 		 838 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_002950  PG1533  TOPRIM domain-containing protein  24.04 
 
 		 682 aa  53.9  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000100507 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  38.55 
 
 		 345 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  32.76 
 
 		 605 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0799  DNA primase  23.74 
 
 		 579 aa  51.6  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.7446  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  38.89 
 
 		 348 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1921  DNA primase-like  21.48 
 
 		 1103 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0501943  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  36.05 
 
 		 102 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  34.67 
 
 		 834 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  37.35 
 
 		 102 aa  47  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3790  DNA primase catalytic core  22.25 
 
 		 1103 aa  47.4  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.443954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  34.88 
 
 		 103 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_21  protein TraI (DNA helicase I)  27.27 
 
 		 1936 aa  46.2  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  23.61 
 
 		 592 aa  45.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  23.11 
 
 		 579 aa  45.1  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5286  hypothetical protein  26.09 
 
 		 971 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.55512  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  30.19 
 
 		 297 aa  44.3  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5420  hypothetical protein  21.46 
 
 		 1170 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>