59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2876 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  100 
 
 		 401 aa  820    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  28.46 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  32.4 
 
 		 575 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  30.25 
 
 		 339 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  34.5 
 
 		 328 aa  99.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  31.54 
 
 		 309 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  29.69 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  31.15 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  28.45 
 
 		 336 aa  88.6  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  33.98 
 
 		 296 aa  86.3  8e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  30.65 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  31.06 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  34.27 
 
 		 355 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  27.93 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  28.24 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  27.96 
 
 		 346 aa  66.6  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  30.48 
 
 		 371 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  28.63 
 
 		 351 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  26.92 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  28.07 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  28.07 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  30.1 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  27.14 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  28.21 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  25.95 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  25 
 
 		 344 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  28.98 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  32.26 
 
 		 355 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  30.21 
 
 		 344 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  26.96 
 
 		 350 aa  53.5  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  30.39 
 
 		 345 aa  53.5  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  30.9 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  29.84 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  25.51 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  27.71 
 
 		 344 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  27.15 
 
 		 350 aa  51.2  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  25.26 
 
 		 353 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  29.85 
 
 		 353 aa  49.3  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  35.19 
 
 		 866 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  26.39 
 
 		 347 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  31.97 
 
 		 665 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  27.03 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  28.16 
 
 		 348 aa  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  26.53 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  25.26 
 
 		 353 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  32.95 
 
 		 299 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  30.04 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  25.56 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  27.18 
 
 		 345 aa  46.2  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  25.09 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  27.85 
 
 		 354 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  29.6 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  29.03 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  24.5 
 
 		 348 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  27.96 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  29.37 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  37.25 
 
 		 298 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>