63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1995 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  100 
 
 
320 aa  639    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  42.72 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  41.58 
 
 
665 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  32.04 
 
 
296 aa  99.8  6e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  33.02 
 
 
293 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  33.9 
 
 
346 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  45.1 
 
 
437 aa  86.3  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  39.89 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  35.65 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  31.56 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  35.19 
 
 
342 aa  75.9  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  32.5 
 
 
312 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  32.89 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  35.15 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  35.15 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  33.8 
 
 
348 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  33.94 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  32.51 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  29.63 
 
 
575 aa  69.3  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.51 
 
 
355 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  32.99 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  34.09 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  31.17 
 
 
348 aa  67  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  33.03 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  45.88 
 
 
930 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  33.16 
 
 
352 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  34.12 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  33.64 
 
 
334 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  31.92 
 
 
346 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  33.52 
 
 
351 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  27.06 
 
 
339 aa  63.9  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  27.35 
 
 
359 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  26.96 
 
 
298 aa  63.9  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  30.89 
 
 
345 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  33.66 
 
 
350 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  33.18 
 
 
348 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  33.94 
 
 
353 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  31.06 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  32.35 
 
 
347 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  33.85 
 
 
353 aa  59.7  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.17 
 
 
347 aa  59.7  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  33.7 
 
 
371 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  31.03 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  32.87 
 
 
353 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  29 
 
 
328 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  31.96 
 
 
344 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  25.86 
 
 
297 aa  56.6  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  31.47 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  32.87 
 
 
348 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  25.8 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  32.62 
 
 
283 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  28.9 
 
 
354 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  30.29 
 
 
345 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  28.27 
 
 
344 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  29.36 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  32.38 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  28.37 
 
 
346 aa  47  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  29.3 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  29.03 
 
 
401 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  33.08 
 
 
292 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  24.52 
 
 
361 aa  45.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  30.71 
 
 
380 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>