59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3920 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  100 
 
 		 280 aa  570  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  49.65 
 
 		 283 aa  258  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  37.41 
 
 		 312 aa  155  8e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  37.05 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  32.3 
 
 		 293 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  32.44 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 334 aa  65.5  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  26.18 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  27.73 
 
 		 346 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  26.9 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  27.68 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  26.22 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  29.5 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  27.21 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  32 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  29.85 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  30.19 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  29.3 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  30.06 
 
 		 345 aa  54.3  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  28.77 
 
 		 353 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  31.09 
 
 		 339 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  48.72 
 
 		 815 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  20.74 
 
 		 867 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  29.61 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  29.61 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  44.9 
 
 		 718 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  26.52 
 
 		 359 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  27.22 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  29.06 
 
 		 345 aa  50.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  26.3 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  28.65 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  34.15 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  26.04 
 
 		 350 aa  51.2  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  28.57 
 
 		 868 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  28.57 
 
 		 868 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  26.46 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  28.57 
 
 		 868 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  30.82 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  55.81 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  52.08 
 
 		 798 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  27 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  47.83 
 
 		 684 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0059  DNA helicase  41.56 
 
 		 875 aa  48.5  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  27.4 
 
 		 351 aa  48.5  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  25.55 
 
 		 355 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  26.25 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  25.84 
 
 		 345 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  28.09 
 
 		 575 aa  46.2  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  29.7 
 
 		 350 aa  45.4  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  25.73 
 
 		 346 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  26.74 
 
 		 348 aa  44.3  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  44.74 
 
 		 696 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  27.06 
 
 		 344 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  46.55 
 
 		 141 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  44.9 
 
 		 147 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  47.73 
 
 		 1776 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  28.41 
 
 		 353 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0903  virulence-associated E family protein  32.59 
 
 		 778 aa  42.7  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  47.5 
 
 		 725 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>