43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4163 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  43.68 
 
 		 718 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  37.56 
 
 		 725 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  29.63 
 
 		 815 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  35.09 
 
 		 880 aa  96.3  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  30.43 
 
 		 868 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  32.3 
 
 		 867 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  30.43 
 
 		 868 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  30.43 
 
 		 868 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  31.28 
 
 		 696 aa  75.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  43.01 
 
 		 701 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  36.44 
 
 		 738 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  38.68 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  26.67 
 
 		 732 aa  59.3  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  39.51 
 
 		 1776 aa  56.6  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  30.67 
 
 		 437 aa  55.8  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  36.27 
 
 		 834 aa  55.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  58 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  42.37 
 
 		 136 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  37.33 
 
 		 127 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  45.61 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  36.94 
 
 		 841 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  45.61 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  50 
 
 		 759 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  29.96 
 
 		 895 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  26.54 
 
 		 731 aa  50.8  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  25.1 
 
 		 684 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  46.03 
 
 		 741 aa  50.8  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  36.19 
 
 		 712 aa  50.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  55.81 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  29.5 
 
 		 759 aa  49.7  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  29.37 
 
 		 590 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  30.61 
 
 		 682 aa  49.3  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  50 
 
 		 293 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  36.73 
 
 		 760 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  43.55 
 
 		 798 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  37.61 
 
 		 739 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  28.87 
 
 		 719 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  28.83 
 
 		 930 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  35.44 
 
 		 277 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  31.78 
 
 		 765 aa  42.7  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  40.85 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>