103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6272 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  100 
 
 
725 aa  1466    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  82.14 
 
 
880 aa  424  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3729  P4 family phage/plasmid primase  43.14 
 
 
874 aa  334  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3780  P4 family phage/plasmid primase  43.14 
 
 
874 aa  334  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  34.58 
 
 
738 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  31.54 
 
 
798 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  34.28 
 
 
765 aa  279  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  35.67 
 
 
759 aa  278  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  35.41 
 
 
760 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  34.15 
 
 
755 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1986  P4 family phage/plasmid primase  34.98 
 
 
717 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2847  P4 family phage/plasmid primase  34.53 
 
 
717 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2865  P4 family phage/plasmid primase  34.53 
 
 
717 aa  244  5e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0870344  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8782  hypothetical protein  35.87 
 
 
482 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3437  hypothetical protein  34.31 
 
 
462 aa  237  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95376  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1244  putative Phage / plasmid primase P4  34.72 
 
 
749 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372159  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1367  P4 family phage/plasmid primase  34.34 
 
 
524 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.357272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1160  hypothetical protein  33.94 
 
 
842 aa  215  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104949  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3426  P4 family phage/plasmid primase  33.12 
 
 
857 aa  213  7.999999999999999e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00902831  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1166  hypothetical protein  35.41 
 
 
467 aa  210  7e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1180  P4 family phage/plasmid primase  32.67 
 
 
843 aa  210  7e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000898776  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0448  Phage-plasmid primase P4-like  32.7 
 
 
746 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0927  P4 family phage/plasmid primase  32.7 
 
 
746 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2797  P4 family phage/plasmid primase  32.92 
 
 
782 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0490  phage/plasmid primase, P4 family  33.8 
 
 
882 aa  197  6e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.958319  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3115  P4 family phage/plasmid primase  32.99 
 
 
695 aa  194  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00327339  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0842  hypothetical protein  31.86 
 
 
526 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464315  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1323  hypothetical protein  31.86 
 
 
526 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103734  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1974  hypothetical protein  33.08 
 
 
485 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1354  hypothetical protein  29.82 
 
 
470 aa  180  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0809995  normal  0.479035 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5167  hypothetical protein  35.58 
 
 
472 aa  179  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7040  hypothetical protein  33.61 
 
 
450 aa  162  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.445259 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1000  Phage/plasmid primase P4-like  23.7 
 
 
723 aa  161  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.760681  hitchhiker  0.00622147 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0135  hypothetical protein  34.17 
 
 
479 aa  160  8e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  39.92 
 
 
867 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2363  P4 family phage/plasmid primase  26.72 
 
 
900 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.134439  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2199  P4 family phage/plasmid primase  27.99 
 
 
554 aa  152  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1465  hypothetical protein  27.04 
 
 
770 aa  151  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.237309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4888  P4 family phage/plasmid primase  31.42 
 
 
697 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.100684  normal  0.121248 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1475  phage DNA polymerase  29.29 
 
 
788 aa  145  3e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0874  nucleoside triphosphatase, D5 family  26.6 
 
 
774 aa  145  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0072  phage/plasmid DNA primase, putative  29.65 
 
 
757 aa  144  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.612885  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  40.25 
 
 
815 aa  136  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0353  P4 family phage/plasmid primase  31.32 
 
 
613 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.764732  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0983  P4 family phage/plasmid primase  30.03 
 
 
612 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  34.84 
 
 
868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  34.84 
 
 
868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  34.84 
 
 
868 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6606  putative Phage / plasmid primase P4  26.57 
 
 
624 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  39.64 
 
 
718 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2662  Phage/plasmid primase P4-like protein  27.88 
 
 
632 aa  121  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  43.6 
 
 
590 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  37.56 
 
 
278 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3752  primase P4-like protein  29.21 
 
 
799 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2911  P4 family phage/plasmid primase  22.95 
 
 
769 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2196  P4 family phage/plasmid primase  28.75 
 
 
955 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.319674  hitchhiker  0.00463191 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  31.65 
 
 
1776 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1052  plasmid/phage primase  23.66 
 
 
828 aa  105  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0990831  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0217  P4 family phage/plasmid primase  23.8 
 
 
486 aa  99  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.01089  unclonable  0.0000111311 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  30.34 
 
 
701 aa  90.1  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  40.44 
 
 
437 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  32.88 
 
 
732 aa  89.7  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  30.57 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5359  P4 family phage/plasmid primase  20.93 
 
 
531 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00485157  hitchhiker  0.00000000000000190106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1315  Phage/plasmid primase P4-like  26.5 
 
 
771 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3095  P4 family phage/plasmid primase  24.22 
 
 
486 aa  80.9  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.406256  normal  0.59304 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0642  Phage or plasmid primase P4-like  23.69 
 
 
540 aa  80.5  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0349968  n/a   
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5581  primase P4  23.64 
 
 
1000 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  34.16 
 
 
895 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  37.86 
 
 
756 aa  68.6  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  31.08 
 
 
741 aa  67.8  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013208  Aaci_3149  phage/plasmid primase, P4 family  26.21 
 
 
1061 aa  66.6  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0665  P4 family phage/plasmid primase  20.11 
 
 
463 aa  64.7  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1684  hypothetical protein  22.22 
 
 
606 aa  59.3  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.521904  hitchhiker  0.00120785 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2258  phage DNA polymerase  19.7 
 
 
542 aa  58.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  55.77 
 
 
141 aa  57.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4492  phage/plasmid primase, P4 family  21.93 
 
 
1172 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4533  P4 family phage/plasmid primase  21.93 
 
 
1172 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  28.57 
 
 
731 aa  55.5  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  50 
 
 
147 aa  55.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2551  P4 family phage/plasmid primase  20.22 
 
 
507 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00685324  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  53.19 
 
 
127 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  48.94 
 
 
136 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5628  P4 family phage/plasmid primase  23.29 
 
 
1145 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000865428 
 
 
-
 
NC_013749  Htur_5275  phage/plasmid primase, P4 family  26.26 
 
 
1285 aa  52.4  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.413265  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  35.94 
 
 
682 aa  52  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  23.51 
 
 
631 aa  51.6  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  44.16 
 
 
759 aa  49.3  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0819  phage DNA polymerase  19.08 
 
 
501 aa  50.1  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.020371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5782  P4 family phage/plasmid primase  24.37 
 
 
978 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  52.5 
 
 
293 aa  47.8  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0710  P4 family phage/plasmid primase  21.62 
 
 
775 aa  47.8  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  50 
 
 
696 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  31.51 
 
 
720 aa  45.8  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  25.87 
 
 
930 aa  45.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0890  D5 family nucleoside triphosphatase  23.28 
 
 
763 aa  45.4  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0320  putative nucleoside triphosphatase, D5 family  25 
 
 
777 aa  45.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.382888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2574  hypothetical protein  23.16 
 
 
426 aa  45.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0564  P4 family phage/plasmid primase  22.04 
 
 
739 aa  45.1  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.68492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4012  D5 family nucleoside triphosphatase  24.89 
 
 
777 aa  44.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>