101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1259 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  100 
 
 		 296 aa  592  1e-168  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  43.55 
 
 		 293 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0232  virulence-associated protein E  36.42 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  34.41 
 
 		 312 aa  122  9e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  34.64 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1995  virulence-associated protein E  32.36 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.356909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  40.36 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  32.13 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3476  hypothetical protein  36.79 
 
 		 328 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459983 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2694  hypothetical protein  35.27 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0978065  hitchhiker  0.00111937 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4199  hypothetical protein  35.58 
 
 		 339 aa  96.3  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.636561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  35.38 
 
 		 283 aa  96.3  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1556  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  35.41 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  0.0581478 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2573  hypothetical protein  34.05 
 
 		 336 aa  94  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.573023 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1853  hypothetical protein  36.71 
 
 		 220 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.053538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3438  virulence-associated protein E  32.01 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  30.63 
 
 		 346 aa  91.3  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  33.85 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0137  hypothetical protein  29.36 
 
 		 575 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.939802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3747  helicase domain-containing protein  36.23 
 
 		 321 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.587064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2876  plasmid-related protein  33.33 
 
 		 401 aa  88.6  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0061217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5493  hypothetical protein  33.79 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709952  normal  0.754037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  32.02 
 
 		 342 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  34.67 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3918  hypothetical protein  30.87 
 
 		 343 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.939983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  34.6 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  32.28 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  32.28 
 
 		 344 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5356  hypothetical protein  30.14 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285049 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  37.8 
 
 		 346 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  33.07 
 
 		 346 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  34.17 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  32.02 
 
 		 346 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  31.84 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  35.68 
 
 		 344 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  33.46 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3166  ATPase-like protein  35.12 
 
 		 665 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.188653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  31.63 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4324  hypothetical protein  31.02 
 
 		 341 aa  72.8  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.414651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  33.2 
 
 		 345 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  32.84 
 
 		 348 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4062  hypothetical protein  31.67 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  31.4 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  32.94 
 
 		 345 aa  70.9  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  32.17 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  34.87 
 
 		 345 aa  70.5  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4271  hypothetical protein  32.41 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  51.67 
 
 		 684 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4734  P4 alpha zinc-binding domain protein  31.84 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  31.03 
 
 		 354 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  35.94 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5209  virulence-associated protein E  29.69 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3025  hypothetical protein  31.78 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  28.43 
 
 		 344 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  31.4 
 
 		 353 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  32.85 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  54.72 
 
 		 696 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  40.91 
 
 		 348 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  31.35 
 
 		 345 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  33.85 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  31.28 
 
 		 350 aa  62.4  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  28.23 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  43.42 
 
 		 718 aa  59.3  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  28.4 
 
 		 380 aa  59.3  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5573  hypothetical protein  28.78 
 
 		 380 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  42.86 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  42.86 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  42.86 
 
 		 868 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3727  phage P4 alpha zinc-binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  43.86 
 
 		 867 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6277  phage P4 alpha zinc-binding protein  33.16 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  58 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  30.23 
 
 		 357 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5218  Phage P4 alpha, zinc-binding  31.48 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  52.94 
 
 		 759 aa  53.9  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  50 
 
 		 741 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  31.35 
 
 		 354 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6543  hypothetical protein  27.7 
 
 		 381 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  55.81 
 
 		 147 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  50 
 
 		 815 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  57.5 
 
 		 141 aa  49.7  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6607  putative DNA primase  26.15 
 
 		 437 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2655  hypothetical protein  36 
 
 		 271 aa  49.3  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  41.67 
 
 		 136 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  39.08 
 
 		 1776 aa  48.9  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4517  conjugative transfer relaxase protein TraI  23.5 
 
 		 1986 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1551  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.67 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5216  P4 alpha zinc-binding domain protein  32.67 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  22.92 
 
 		 573 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4591  conjugative transfer relaxase protein TraI  23 
 
 		 1986 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.836035 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  39.66 
 
 		 798 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4429  conjugative transfer relaxase protein TraI  23 
 
 		 1986 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4614  conjugative transfer relaxase protein TraI  23 
 
 		 1986 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.441431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4392  conjugative transfer relaxase protein TraI  23 
 
 		 1986 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3240  DNA primase  31.51 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1631  hypothetical protein  27.21 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4421  conjugative transfer relaxase protein TraI  23 
 
 		 1986 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.478197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  35.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  30.72 
 
 		 388 aa  43.1  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  52.5 
 
 		 895 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>