31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4350 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  100 
 
 		 136 aa  276  9e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  59.68 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  47.56 
 
 		 147 aa  87  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  54.55 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  38.64 
 
 		 868 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  38.64 
 
 		 868 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  38.64 
 
 		 868 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  38.2 
 
 		 867 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  40.51 
 
 		 895 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  44.29 
 
 		 798 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  39.19 
 
 		 815 aa  61.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2005  hypothetical protein  34.34 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.598822  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  42.25 
 
 		 741 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  41.89 
 
 		 718 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  44 
 
 		 759 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  42.37 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  32.71 
 
 		 312 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  48.94 
 
 		 725 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  48.94 
 
 		 880 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1776 aa  51.6  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  41.67 
 
 		 296 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  47.83 
 
 		 293 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1826  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.297533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  30.58 
 
 		 309 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1125  DNA primase  25.19 
 
 		 716 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.726784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  32.89 
 
 		 703 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  23.08 
 
 		 640 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0641  DNA primase  28.26 
 
 		 572 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  37.1 
 
 		 283 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  44.74 
 
 		 280 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1259  DNA primase  35.29 
 
 		 720 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>