113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6607 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6607  putative DNA primase  100 
 
 		 437 aa  889    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2200  putative DNA primase  36.43 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0613  putative DNA primase  44.44 
 
 		 401 aa  176  9e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0352  hypothetical protein  31.64 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0981  hypothetical protein  31.63 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.887323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  34.52 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  35.71 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.33 
 
 		 600 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  57  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.33 
 
 		 571 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  34.44 
 
 		 616 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  34.44 
 
 		 639 aa  56.6  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  33.33 
 
 		 656 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  36.67 
 
 		 649 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  33.33 
 
 		 645 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  34.78 
 
 		 629 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  35.16 
 
 		 640 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  35.16 
 
 		 640 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  35.16 
 
 		 640 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  35.56 
 
 		 647 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.11 
 
 		 584 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  34.44 
 
 		 629 aa  54.7  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.41 
 
 		 587 aa  53.9  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  32.64 
 
 		 345 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  36.14 
 
 		 588 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  35.16 
 
 		 657 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  34.94 
 
 		 590 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0432  DNA primase  34.04 
 
 		 560 aa  52  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.728386  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  30 
 
 		 623 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.94 
 
 		 590 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  35.42 
 
 		 652 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  36.17 
 
 		 656 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  33.33 
 
 		 639 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  27.44 
 
 		 293 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  35.71 
 
 		 651 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  32.17 
 
 		 576 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1342  DNA primase  35.48 
 
 		 565 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  32.26 
 
 		 600 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1344  DNA primase  35.48 
 
 		 565 aa  50.4  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0114942  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  32.61 
 
 		 655 aa  50.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1531  DNA primase  26.21 
 
 		 535 aa  50.1  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  30 
 
 		 587 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  35.11 
 
 		 629 aa  50.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0861  DNA primase  33.98 
 
 		 609 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0925176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  32.14 
 
 		 652 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  34.74 
 
 		 639 aa  48.5  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  32.61 
 
 		 641 aa  48.9  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  35.56 
 
 		 667 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  31.18 
 
 		 604 aa  48.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.67 
 
 		 605 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.44 
 
 		 593 aa  48.5  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  32.71 
 
 		 572 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.33 
 
 		 588 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  29.79 
 
 		 583 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  30.12 
 
 		 580 aa  48.5  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  29.79 
 
 		 582 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  29.79 
 
 		 718 aa  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  31.18 
 
 		 634 aa  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  34.41 
 
 		 641 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1045  hypothetical protein  31.25 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.777717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  34.41 
 
 		 641 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  30.68 
 
 		 564 aa  47.8  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  27.27 
 
 		 588 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2316  DNA primase  35.48 
 
 		 633 aa  47.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.102416  normal  0.0205007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  28.72 
 
 		 599 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  31.93 
 
 		 605 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  28.72 
 
 		 699 aa  47  0.0006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  33.01 
 
 		 599 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  32.97 
 
 		 618 aa  47  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  29.67 
 
 		 611 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0961  DNA primase  32.17 
 
 		 579 aa  47  0.0007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  30.77 
 
 		 624 aa  47  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  27.86 
 
 		 350 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  31.52 
 
 		 655 aa  46.6  0.0008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  28.57 
 
 		 605 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  28.57 
 
 		 605 aa  46.6  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0023  DNA primase  32.65 
 
 		 550 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2883  DNA primase  34.78 
 
 		 620 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.257666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  29.91 
 
 		 640 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  30.07 
 
 		 354 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4263  DNA primase  33.33 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  29.79 
 
 		 632 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  29.79 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  32.14 
 
 		 645 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1631  hypothetical protein  32.35 
 
 		 280 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.208567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  30.68 
 
 		 628 aa  44.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  30.85 
 
 		 530 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.26 
 
 		 626 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  27.47 
 
 		 614 aa  44.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  36.36 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3449  DNA primase  31.63 
 
 		 646 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  32.26 
 
 		 642 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>