More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0527 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0552  DNA primase  91.02 
 
 		 590 aa  1118    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  100 
 
 		 588 aa  1216    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  91.19 
 
 		 590 aa  1114    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  38.1 
 
 		 645 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  39.95 
 
 		 655 aa  345  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  37.2 
 
 		 652 aa  342  9e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.74 
 
 		 623 aa  330  3e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  33.82 
 
 		 651 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.17 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.08 
 
 		 604 aa  307  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.94 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  36.3 
 
 		 595 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.49 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.26 
 
 		 605 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.73 
 
 		 598 aa  297  3e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.48 
 
 		 595 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.76 
 
 		 599 aa  295  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  34.68 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.99 
 
 		 599 aa  292  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.16 
 
 		 588 aa  289  9e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.54 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  37.26 
 
 		 564 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  32.5 
 
 		 601 aa  286  8e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.9 
 
 		 599 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.94 
 
 		 593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.67 
 
 		 611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.95 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.84 
 
 		 617 aa  281  3e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.83 
 
 		 583 aa  280  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  36.64 
 
 		 641 aa  280  6e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  34.19 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  36.74 
 
 		 613 aa  276  6e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  40.51 
 
 		 587 aa  276  9e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.4 
 
 		 582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  39.89 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.26 
 
 		 571 aa  272  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  33.07 
 
 		 623 aa  271  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  33.02 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  33.02 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.24 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  33.02 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  33.02 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  33.02 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.02 
 
 		 600 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.91 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  31.31 
 
 		 584 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  35.14 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  32.79 
 
 		 598 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.71 
 
 		 598 aa  267  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.71 
 
 		 598 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  34.61 
 
 		 684 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.62 
 
 		 587 aa  266  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  35.49 
 
 		 592 aa  265  1e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  34.56 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  34.56 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  31.69 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.48 
 
 		 675 aa  264  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  31.96 
 
 		 655 aa  263  6.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.08 
 
 		 604 aa  263  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  29.62 
 
 		 614 aa  262  1e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.85 
 
 		 619 aa  262  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  33.39 
 
 		 592 aa  261  3e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  33.26 
 
 		 626 aa  260  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  32.11 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  33.6 
 
 		 690 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.23 
 
 		 596 aa  258  3e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  36.84 
 
 		 606 aa  257  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  33.7 
 
 		 594 aa  256  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  36.28 
 
 		 653 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  33.03 
 
 		 656 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0485  DNA primase  33.4 
 
 		 595 aa  254  3e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  31.98 
 
 		 676 aa  254  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  36.14 
 
 		 641 aa  253  7e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.43 
 
 		 686 aa  253  8.000000000000001e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  32.72 
 
 		 660 aa  253  9.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36 
 
 		 651 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  35.89 
 
 		 642 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  33.85 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.52 
 
 		 656 aa  252  1e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  30.66 
 
 		 601 aa  252  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  31.92 
 
 		 636 aa  252  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  33.81 
 
 		 591 aa  251  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  30.06 
 
 		 656 aa  250  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  33.72 
 
 		 678 aa  250  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  31.82 
 
 		 677 aa  250  6e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36 
 
 		 652 aa  250  7e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  33.57 
 
 		 539 aa  250  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  33.69 
 
 		 577 aa  249  8e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  33.41 
 
 		 682 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  31.59 
 
 		 677 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  31.82 
 
 		 677 aa  249  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  32.43 
 
 		 624 aa  249  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  32.16 
 
 		 578 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  35.03 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  31.65 
 
 		 662 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.93 
 
 		 638 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  30.15 
 
 		 658 aa  248  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  31.9 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  34.2 
 
 		 645 aa  248  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>