More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1716 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  100 
 
 
626 aa  1272    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  58.39 
 
 
642 aa  718    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  54.71 
 
 
618 aa  674    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  39.46 
 
 
655 aa  388  1e-106  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  40.45 
 
 
652 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  37.36 
 
 
616 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  35.54 
 
 
629 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  33.82 
 
 
604 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  37.84 
 
 
645 aa  296  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.56 
 
 
663 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.39 
 
 
605 aa  295  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.51 
 
 
664 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  37.85 
 
 
623 aa  294  3e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  36.14 
 
 
616 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  37.22 
 
 
624 aa  293  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  37.38 
 
 
632 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  40.93 
 
 
599 aa  288  2e-76  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.4 
 
 
613 aa  288  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  41.12 
 
 
604 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  31.47 
 
 
600 aa  287  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  38.2 
 
 
657 aa  287  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.75 
 
 
660 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.25 
 
 
660 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  41.42 
 
 
655 aa  286  8e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40.5 
 
 
652 aa  286  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.25 
 
 
660 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  36.5 
 
 
667 aa  286  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  39.21 
 
 
700 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40 
 
 
660 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  39.82 
 
 
627 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.5 
 
 
614 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.85 
 
 
655 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  35.98 
 
 
594 aa  283  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.01 
 
 
588 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.1 
 
 
565 aa  283  8.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.36 
 
 
598 aa  283  9e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  33.39 
 
 
598 aa  283  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.85 
 
 
651 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.02 
 
 
617 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  41.23 
 
 
599 aa  281  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.06 
 
 
571 aa  281  4e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.06 
 
 
598 aa  280  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  40.5 
 
 
638 aa  280  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  37.99 
 
 
629 aa  280  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.93 
 
 
595 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  40.33 
 
 
592 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  39.01 
 
 
656 aa  278  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  30.33 
 
 
601 aa  277  5e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  35.74 
 
 
699 aa  276  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  39.15 
 
 
583 aa  276  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.47 
 
 
595 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  34.57 
 
 
641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  37.9 
 
 
601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  37.58 
 
 
588 aa  274  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38.96 
 
 
584 aa  274  3e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  39.04 
 
 
631 aa  274  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  34.34 
 
 
588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.09 
 
 
663 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  35.63 
 
 
639 aa  273  7e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.3 
 
 
600 aa  273  7e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  32.14 
 
 
578 aa  273  8.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  33.89 
 
 
599 aa  273  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.1 
 
 
587 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35 
 
 
604 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  40 
 
 
576 aa  272  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  36.29 
 
 
636 aa  272  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.72 
 
 
613 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  37.18 
 
 
609 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  39.1 
 
 
578 aa  269  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37.26 
 
 
694 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  36.38 
 
 
585 aa  268  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  33.46 
 
 
577 aa  268  2e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  32.48 
 
 
586 aa  268  2e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.76 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.76 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  33.46 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  38.07 
 
 
639 aa  268  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  38.39 
 
 
586 aa  267  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  36.43 
 
 
599 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.76 
 
 
582 aa  268  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  267  5e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  267  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.76 
 
 
581 aa  267  5e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  267  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.76 
 
 
581 aa  267  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  35.03 
 
 
578 aa  266  7e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  33.72 
 
 
588 aa  266  7e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  37.44 
 
 
656 aa  266  7e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  37.92 
 
 
583 aa  266  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>