More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3790 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3090  DNA primase  59.66 
 
 		 587 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  59.8 
 
 		 588 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  100 
 
 		 582 aa  1188    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  59.52 
 
 		 587 aa  710    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  96.74 
 
 		 583 aa  1150    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  49.83 
 
 		 584 aa  559  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  46.89 
 
 		 588 aa  544  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  41.42 
 
 		 604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  41.22 
 
 		 613 aa  363  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 604 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  40.93 
 
 		 614 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.45 
 
 		 626 aa  340  4e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  43.56 
 
 		 599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.74 
 
 		 619 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  43.34 
 
 		 599 aa  334  3e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  40.14 
 
 		 605 aa  330  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.74 
 
 		 601 aa  329  8e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.84 
 
 		 599 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.91 
 
 		 593 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.53 
 
 		 605 aa  323  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  34.31 
 
 		 571 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39 
 
 		 600 aa  323  6e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  32.5 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  320  6e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.31 
 
 		 598 aa  320  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.65 
 
 		 623 aa  320  6e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.12 
 
 		 595 aa  316  6e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33 
 
 		 601 aa  316  8e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.55 
 
 		 674 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.67 
 
 		 660 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.37 
 
 		 660 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.14 
 
 		 660 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.23 
 
 		 633 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.73 
 
 		 598 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.41 
 
 		 636 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.56 
 
 		 604 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  33.44 
 
 		 631 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  33.22 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.11 
 
 		 632 aa  310  4e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.67 
 
 		 655 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.49 
 
 		 660 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.43 
 
 		 651 aa  309  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.43 
 
 		 652 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.7 
 
 		 663 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  39.49 
 
 		 660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  37.42 
 
 		 632 aa  306  6e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.1 
 
 		 663 aa  306  7e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.2 
 
 		 598 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.1 
 
 		 664 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  37.18 
 
 		 704 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  34.21 
 
 		 703 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  38.58 
 
 		 623 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  35.8 
 
 		 673 aa  303  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  31.84 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  38.12 
 
 		 647 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  35.92 
 
 		 660 aa  300  7e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.32 
 
 		 595 aa  299  8e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0757  DNA primase  38.76 
 
 		 647 aa  299  1e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.255391  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.48 
 
 		 638 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.34 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  34.01 
 
 		 653 aa  297  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  34.58 
 
 		 662 aa  297  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  36.57 
 
 		 616 aa  297  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  38.5 
 
 		 636 aa  296  7e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  35.03 
 
 		 577 aa  296  8e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  35.74 
 
 		 592 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  31.01 
 
 		 596 aa  295  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.83 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.84 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  34.39 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.61 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  35.29 
 
 		 656 aa  293  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.61 
 
 		 581 aa  293  7e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  35.88 
 
 		 629 aa  292  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  37.03 
 
 		 658 aa  290  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  33.95 
 
 		 544 aa  290  4e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  34.68 
 
 		 582 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  38.93 
 
 		 645 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  34.39 
 
 		 584 aa  290  6e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.39 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.39 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.39 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.39 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.39 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.39 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.34 
 
 		 617 aa  289  1e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  38.5 
 
 		 639 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.35 
 
 		 640 aa  288  1e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  36.31 
 
 		 640 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.5 
 
 		 646 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.5 
 
 		 646 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.04 
 
 		 656 aa  287  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  34.95 
 
 		 634 aa  287  4e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  36.53 
 
 		 598 aa  287  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>