More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1508 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  100 
 
 		 593 aa  1201    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.8 
 
 		 599 aa  346  6e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  40.52 
 
 		 614 aa  343  5e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  39.86 
 
 		 601 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.22 
 
 		 595 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  40.28 
 
 		 613 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  40.28 
 
 		 600 aa  334  2e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34 
 
 		 583 aa  333  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.83 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.28 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  44.06 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  44.06 
 
 		 595 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.86 
 
 		 604 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  43.32 
 
 		 577 aa  325  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.91 
 
 		 582 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.99 
 
 		 626 aa  322  9.999999999999999e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  40.14 
 
 		 632 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.46 
 
 		 599 aa  320  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  32.07 
 
 		 588 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.5 
 
 		 598 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.85 
 
 		 587 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.57 
 
 		 619 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  37.59 
 
 		 604 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.88 
 
 		 599 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  38.97 
 
 		 578 aa  311  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39.44 
 
 		 584 aa  310  6.999999999999999e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.16 
 
 		 598 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  36.57 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.95 
 
 		 598 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.95 
 
 		 598 aa  308  3e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  33.72 
 
 		 611 aa  307  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.95 
 
 		 598 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.95 
 
 		 598 aa  307  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.95 
 
 		 598 aa  308  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.41 
 
 		 636 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.8 
 
 		 598 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.74 
 
 		 571 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.96 
 
 		 544 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  38.22 
 
 		 632 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.52 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.33 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.52 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.44 
 
 		 588 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  38.58 
 
 		 652 aa  302  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  38.23 
 
 		 598 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.34 
 
 		 601 aa  301  3e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 604 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  36.09 
 
 		 653 aa  298  1e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  38.14 
 
 		 631 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  37.7 
 
 		 630 aa  294  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  37.91 
 
 		 617 aa  293  8e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.74 
 
 		 673 aa  292  1e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  43.02 
 
 		 651 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.3 
 
 		 638 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  35.45 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.18 
 
 		 660 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.18 
 
 		 660 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  36.7 
 
 		 567 aa  290  6e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  42.17 
 
 		 655 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  36.23 
 
 		 633 aa  290  7e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.18 
 
 		 660 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.92 
 
 		 590 aa  290  7e-77  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  36.53 
 
 		 660 aa  290  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  43.02 
 
 		 652 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  39.05 
 
 		 605 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  39.05 
 
 		 605 aa  289  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.95 
 
 		 663 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.62 
 
 		 660 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.99 
 
 		 664 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  38.8 
 
 		 596 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.07 
 
 		 660 aa  286  7e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  34.94 
 
 		 588 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  40.73 
 
 		 645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  35.93 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  35.36 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  37.44 
 
 		 651 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  40.97 
 
 		 674 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.36 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  34.92 
 
 		 605 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  33.53 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.95 
 
 		 666 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  41.6 
 
 		 663 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  41.55 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  42.15 
 
 		 655 aa  278  2e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  41.37 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.76 
 
 		 656 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.1 
 
 		 571 aa  277  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  42.02 
 
 		 577 aa  277  5e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  34.58 
 
 		 704 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  36.6 
 
 		 602 aa  276  7e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  42.02 
 
 		 577 aa  276  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  33.45 
 
 		 623 aa  276  7e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  33.72 
 
 		 656 aa  276  8e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  32.73 
 
 		 578 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  41.41 
 
 		 652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35 
 
 		 703 aa  274  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.83 
 
 		 564 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  39.94 
 
 		 591 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  33.2 
 
 		 614 aa  273  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  40.11 
 
 		 592 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>