More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0256 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  83.38 
 
 
651 aa  1081    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  100 
 
 
652 aa  1331    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  48.71 
 
 
645 aa  601  1e-170  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  45.29 
 
 
655 aa  555  1e-157  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  40.62 
 
 
623 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.85 
 
 
605 aa  362  1e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  37.67 
 
 
590 aa  359  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  37.2 
 
 
588 aa  352  8.999999999999999e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  37.98 
 
 
590 aa  352  1e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.57 
 
 
599 aa  342  1e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.62 
 
 
626 aa  330  5.0000000000000004e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  38.89 
 
 
587 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35.56 
 
 
588 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  39.23 
 
 
605 aa  309  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.99 
 
 
587 aa  307  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.29 
 
 
600 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.43 
 
 
682 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.58 
 
 
593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.22 
 
 
613 aa  302  1e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.12 
 
 
601 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  37 
 
 
686 aa  301  3e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.71 
 
 
595 aa  300  4e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.66 
 
 
588 aa  299  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.43 
 
 
614 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.13 
 
 
675 aa  297  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.23 
 
 
595 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.89 
 
 
595 aa  295  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.33 
 
 
604 aa  293  1e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.45 
 
 
599 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  35.97 
 
 
684 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.57 
 
 
598 aa  290  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34 
 
 
584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  38.17 
 
 
640 aa  290  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.15 
 
 
604 aa  289  1e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.7 
 
 
583 aa  289  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.66 
 
 
601 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  32.08 
 
 
599 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.93 
 
 
582 aa  287  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.12 
 
 
598 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  36.82 
 
 
675 aa  286  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  39.81 
 
 
564 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.48 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.48 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.48 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.48 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.48 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  36.65 
 
 
646 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.48 
 
 
571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  36.03 
 
 
694 aa  282  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  36.65 
 
 
646 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.25 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.25 
 
 
598 aa  281  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.13 
 
 
611 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  36.42 
 
 
574 aa  280  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.25 
 
 
598 aa  280  6e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  37.29 
 
 
690 aa  280  7e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.88 
 
 
600 aa  280  7e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  37.18 
 
 
577 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  37.28 
 
 
636 aa  278  3e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.39 
 
 
604 aa  278  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  36.15 
 
 
617 aa  278  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  33.65 
 
 
679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  30.94 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  33.95 
 
 
596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  36.88 
 
 
634 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.04 
 
 
656 aa  273  6e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  34.41 
 
 
573 aa  273  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  32.83 
 
 
636 aa  271  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.9 
 
 
598 aa  270  5e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  36.36 
 
 
639 aa  269  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  36.82 
 
 
641 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.76 
 
 
614 aa  268  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.58 
 
 
617 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  39.51 
 
 
587 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  33.63 
 
 
605 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.7 
 
 
655 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  33.63 
 
 
605 aa  266  5.999999999999999e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.36 
 
 
638 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  36.81 
 
 
631 aa  266  7e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  37.78 
 
 
619 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  30.08 
 
 
677 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.43 
 
 
613 aa  265  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  36.57 
 
 
647 aa  265  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  39.6 
 
 
578 aa  264  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  29.73 
 
 
677 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.96 
 
 
651 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  32.58 
 
 
576 aa  263  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  36.2 
 
 
587 aa  263  8.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.35 
 
 
652 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  29.7 
 
 
677 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  35.37 
 
 
663 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.78 
 
 
676 aa  261  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.74 
 
 
660 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  33.4 
 
 
583 aa  261  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  34.26 
 
 
660 aa  260  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  33.21 
 
 
660 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  30.86 
 
 
678 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  35.35 
 
 
567 aa  261  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  36.69 
 
 
664 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.53 
 
 
579 aa  260  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>