More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0313 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  100 
 
 		 578 aa  1189    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  39.21 
 
 		 601 aa  334  3e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.3 
 
 		 626 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  42.92 
 
 		 599 aa  322  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.73 
 
 		 605 aa  320  5e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.13 
 
 		 599 aa  319  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  39.82 
 
 		 598 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.29 
 
 		 600 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.97 
 
 		 593 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 604 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.43 
 
 		 598 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.43 
 
 		 598 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.43 
 
 		 598 aa  309  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.43 
 
 		 598 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.43 
 
 		 598 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.43 
 
 		 571 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.15 
 
 		 614 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.19 
 
 		 598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.19 
 
 		 598 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.95 
 
 		 598 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.19 
 
 		 598 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.33 
 
 		 604 aa  303  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  40.24 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  35.63 
 
 		 596 aa  300  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.09 
 
 		 619 aa  297  3e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.81 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  37.41 
 
 		 653 aa  293  5e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.08 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.52 
 
 		 600 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  34.65 
 
 		 640 aa  290  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  41.46 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  37.19 
 
 		 601 aa  287  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.53 
 
 		 703 aa  286  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.91 
 
 		 673 aa  284  3.0000000000000004e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  31.63 
 
 		 583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.6 
 
 		 662 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  32.22 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  35 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.48 
 
 		 582 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  38.5 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.37 
 
 		 632 aa  280  4e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  40.91 
 
 		 598 aa  279  9e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  39.24 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.92 
 
 		 587 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  31.45 
 
 		 651 aa  279  1e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.38 
 
 		 674 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.59 
 
 		 611 aa  277  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  31.48 
 
 		 601 aa  276  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  41.42 
 
 		 544 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  31.59 
 
 		 609 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  36.93 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  36.07 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  36.07 
 
 		 605 aa  274  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.29 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.29 
 
 		 581 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  36.76 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  36.16 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  36.21 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  36.38 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  36.21 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  36.21 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.21 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  36.21 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39.57 
 
 		 604 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.09 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  36.16 
 
 		 574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.09 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.43 
 
 		 595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  36.16 
 
 		 574 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.14 
 
 		 584 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.16 
 
 		 599 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.08 
 
 		 676 aa  270  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  30.94 
 
 		 652 aa  270  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  37.24 
 
 		 575 aa  270  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  35.79 
 
 		 574 aa  270  5e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  36.38 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.11 
 
 		 626 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  34.3 
 
 		 656 aa  268  2e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.71 
 
 		 617 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0980  DNA primase  36.75 
 
 		 625 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.416677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  36.31 
 
 		 583 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.17 
 
 		 601 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.69 
 
 		 613 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  36.16 
 
 		 574 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.12 
 
 		 584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  37.26 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  36.16 
 
 		 574 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.81 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.97 
 
 		 595 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.3 
 
 		 575 aa  266  8e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  34.69 
 
 		 582 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  34.69 
 
 		 582 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.2 
 
 		 623 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.69 
 
 		 582 aa  266  8.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  33.41 
 
 		 640 aa  265  2e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>