More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2679 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  100 
 
 		 604 aa  1220    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  41.8 
 
 		 583 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  40.8 
 
 		 587 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  41.42 
 
 		 582 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  43.67 
 
 		 588 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  42.76 
 
 		 587 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  40.97 
 
 		 588 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39.33 
 
 		 584 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  41.78 
 
 		 613 aa  363  5.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.52 
 
 		 599 aa  352  2e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 604 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  41.84 
 
 		 599 aa  350  4e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.32 
 
 		 605 aa  342  8e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.03 
 
 		 614 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  40.86 
 
 		 593 aa  339  9e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  337  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  337  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  41.25 
 
 		 571 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  336  7e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  336  9e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  41.05 
 
 		 600 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  41.25 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  46.54 
 
 		 619 aa  335  2e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.41 
 
 		 598 aa  333  4e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.77 
 
 		 601 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.74 
 
 		 660 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.03 
 
 		 652 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.15 
 
 		 655 aa  330  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.85 
 
 		 660 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  40.78 
 
 		 605 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.81 
 
 		 660 aa  329  8e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.81 
 
 		 660 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.22 
 
 		 663 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.81 
 
 		 651 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  42.02 
 
 		 664 aa  327  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.08 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.44 
 
 		 638 aa  325  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.56 
 
 		 600 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  38.41 
 
 		 578 aa  324  2e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  37.07 
 
 		 601 aa  325  2e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  40.18 
 
 		 582 aa  322  1.9999999999999998e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  40.35 
 
 		 674 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  37.5 
 
 		 626 aa  320  6e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  39.02 
 
 		 660 aa  319  7.999999999999999e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.79 
 
 		 599 aa  316  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  42.69 
 
 		 611 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.78 
 
 		 663 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  39.62 
 
 		 598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  39.91 
 
 		 703 aa  313  3.9999999999999997e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  42.32 
 
 		 617 aa  313  5.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  40.6 
 
 		 676 aa  310  4e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.58 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.58 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.58 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  40.47 
 
 		 614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  33.82 
 
 		 598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  35.97 
 
 		 571 aa  307  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  40 
 
 		 630 aa  306  9.000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  40.36 
 
 		 660 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  36.33 
 
 		 632 aa  304  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.35 
 
 		 604 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  40.12 
 
 		 582 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  42.23 
 
 		 576 aa  303  8.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  42.13 
 
 		 659 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.52 
 
 		 601 aa  302  1e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.43 
 
 		 579 aa  302  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  35.54 
 
 		 653 aa  302  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  40.08 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  38.22 
 
 		 584 aa  299  8e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  38.06 
 
 		 581 aa  299  9e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  35.45 
 
 		 596 aa  299  9e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.31 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  39.73 
 
 		 584 aa  299  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  38.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  38.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  38.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  37.42 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  41.36 
 
 		 626 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  37.42 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.15 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  38.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  38.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  38.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  37.42 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.05 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  37.42 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  38.95 
 
 		 574 aa  298  3e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.26 
 
 		 640 aa  297  5e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  38.36 
 
 		 581 aa  296  5e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.78 
 
 		 666 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.21 
 
 		 656 aa  296  7e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  37.05 
 
 		 633 aa  296  8e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  35.7 
 
 		 673 aa  295  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  38.14 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  38.14 
 
 		 581 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  32.41 
 
 		 657 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  39.35 
 
 		 677 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>