More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0540 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  100 
 
 		 604 aa  1221    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  50.6 
 
 		 600 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  49.65 
 
 		 595 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  49.42 
 
 		 595 aa  413  1e-114  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  38.05 
 
 		 595 aa  399  1e-109  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.73 
 
 		 596 aa  371  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  42.79 
 
 		 599 aa  361  3e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  40.51 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  40.28 
 
 		 598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  40 
 
 		 598 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  40 
 
 		 598 aa  356  7.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  40 
 
 		 571 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  40 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  40 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  40 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  41.1 
 
 		 598 aa  355  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  40.28 
 
 		 598 aa  353  7e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.64 
 
 		 601 aa  352  8e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  41.4 
 
 		 617 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.4 
 
 		 600 aa  351  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 604 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  41.51 
 
 		 599 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.03 
 
 		 605 aa  345  1e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.52 
 
 		 614 aa  343  4e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.25 
 
 		 599 aa  342  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  40 
 
 		 626 aa  342  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  41.45 
 
 		 588 aa  337  5e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  39.18 
 
 		 598 aa  336  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  41.08 
 
 		 613 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.29 
 
 		 601 aa  333  4e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.1 
 
 		 619 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.93 
 
 		 587 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  40.73 
 
 		 663 aa  323  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40 
 
 		 655 aa  319  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  40.19 
 
 		 587 aa  319  1e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.01 
 
 		 583 aa  318  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.22 
 
 		 663 aa  317  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.47 
 
 		 664 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  37.59 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.86 
 
 		 651 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.56 
 
 		 582 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  40.24 
 
 		 614 aa  313  6.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  37.42 
 
 		 544 aa  312  1e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.13 
 
 		 660 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.63 
 
 		 652 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  37.56 
 
 		 590 aa  310  5e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.18 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  37.79 
 
 		 590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.95 
 
 		 660 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.94 
 
 		 638 aa  308  2.0000000000000002e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.05 
 
 		 660 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  37.08 
 
 		 588 aa  307  3e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  36.49 
 
 		 586 aa  307  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.58 
 
 		 588 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  38.37 
 
 		 636 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.22 
 
 		 613 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.73 
 
 		 611 aa  300  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  35.74 
 
 		 660 aa  299  1e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  37.45 
 
 		 703 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  38.42 
 
 		 684 aa  298  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  38.12 
 
 		 586 aa  298  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  38.17 
 
 		 686 aa  298  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  35.88 
 
 		 582 aa  297  3e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  38.44 
 
 		 675 aa  297  3e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.17 
 
 		 588 aa  297  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  38.64 
 
 		 682 aa  296  5e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  36.07 
 
 		 632 aa  296  7e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  38.94 
 
 		 609 aa  296  7e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.18 
 
 		 660 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.53 
 
 		 640 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.05 
 
 		 617 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  35.1 
 
 		 679 aa  295  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.7 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.35 
 
 		 604 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  36.12 
 
 		 694 aa  293  5e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  33.88 
 
 		 571 aa  293  7e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  37.59 
 
 		 630 aa  292  1e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.81 
 
 		 656 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  39.87 
 
 		 577 aa  291  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  39.68 
 
 		 591 aa  291  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.41 
 
 		 633 aa  291  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  38.15 
 
 		 574 aa  290  4e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  35.33 
 
 		 652 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.81 
 
 		 674 aa  290  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  39 
 
 		 576 aa  290  8e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  36.6 
 
 		 636 aa  289  8e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  37.72 
 
 		 673 aa  288  2e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  37.72 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  38.03 
 
 		 601 aa  288  2e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  37.86 
 
 		 577 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.7 
 
 		 584 aa  287  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.32 
 
 		 592 aa  287  5e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  36.99 
 
 		 606 aa  286  5e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  37.22 
 
 		 574 aa  287  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  38.63 
 
 		 575 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  37.22 
 
 		 574 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  36.78 
 
 		 653 aa  286  8e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  33.12 
 
 		 582 aa  286  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  37.22 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  34.4 
 
 		 582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>