More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1175 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  71.11 
 
 		 679 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  66.12 
 
 		 675 aa  956    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09401  DNA primase  64.53 
 
 		 625 aa  861    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.029627  normal  0.0569121 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  90.87 
 
 		 686 aa  1222    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  100 
 
 		 682 aa  1382    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09191  DNA primase  53.49 
 
 		 677 aa  802    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  52.75 
 
 		 677 aa  792    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  57.8 
 
 		 694 aa  773    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  55.1 
 
 		 678 aa  820    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1824  DNA primase  50.29 
 
 		 690 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.982037  normal  0.672025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  83.48 
 
 		 684 aa  1167    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  53.05 
 
 		 677 aa  800    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  47.73 
 
 		 640 aa  537  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  50 
 
 		 646 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  50 
 
 		 646 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  42.16 
 
 		 675 aa  525  1e-147  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  47.56 
 
 		 634 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  50.29 
 
 		 636 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  37.62 
 
 		 626 aa  319  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.07 
 
 		 599 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.7 
 
 		 600 aa  301  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.67 
 
 		 595 aa  300  5e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.57 
 
 		 605 aa  299  9e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  37.43 
 
 		 652 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.64 
 
 		 604 aa  296  6e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.04 
 
 		 613 aa  295  2e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.59 
 
 		 656 aa  293  7e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  41.08 
 
 		 617 aa  293  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.89 
 
 		 595 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.7 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.94 
 
 		 619 aa  290  4e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.14 
 
 		 588 aa  290  8e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.9 
 
 		 613 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.31 
 
 		 599 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  43.1 
 
 		 638 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  40.43 
 
 		 645 aa  288  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 604 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.15 
 
 		 655 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.03 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  42.11 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  39.06 
 
 		 574 aa  284  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.88 
 
 		 663 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  41.53 
 
 		 614 aa  282  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40.14 
 
 		 652 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.62 
 
 		 651 aa  282  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.47 
 
 		 664 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  38.73 
 
 		 660 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  40.05 
 
 		 651 aa  280  6e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.29 
 
 		 660 aa  280  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  40.33 
 
 		 652 aa  279  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  39.72 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.91 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  38.12 
 
 		 618 aa  278  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.99 
 
 		 663 aa  278  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37.11 
 
 		 674 aa  278  3e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.05 
 
 		 660 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.05 
 
 		 660 aa  277  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  37.69 
 
 		 571 aa  277  5e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  38.68 
 
 		 584 aa  277  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  35.61 
 
 		 588 aa  277  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  38.68 
 
 		 584 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.05 
 
 		 660 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  38.79 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  38.79 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.28 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  38.79 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  38.79 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  38.79 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  38.79 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  37.12 
 
 		 655 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  36.34 
 
 		 636 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  41.69 
 
 		 588 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  38.79 
 
 		 581 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  38.85 
 
 		 616 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.75 
 
 		 587 aa  273  9e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.51 
 
 		 703 aa  272  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.68 
 
 		 666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  36.19 
 
 		 601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  38.21 
 
 		 582 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.94 
 
 		 676 aa  271  4e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  38.68 
 
 		 584 aa  270  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  39.68 
 
 		 592 aa  270  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.46 
 
 		 599 aa  269  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  37.22 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  39.13 
 
 		 660 aa  268  2e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.44 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  39.63 
 
 		 553 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  36.56 
 
 		 630 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  39.63 
 
 		 572 aa  268  2e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  38.95 
 
 		 575 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  38.8 
 
 		 583 aa  268  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.44 
 
 		 581 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  37.44 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.03 
 
 		 633 aa  268  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  39.73 
 
 		 622 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  37.44 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  37.44 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  37.1 
 
 		 586 aa  267  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>