More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1835 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  100 
 
 		 623 aa  1279    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  40.62 
 
 		 652 aa  418  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  37.74 
 
 		 651 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0014  DNA primase  38.2 
 
 		 645 aa  394  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0081672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  41.7 
 
 		 655 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  39.88 
 
 		 588 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.53 
 
 		 599 aa  350  6e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  34.74 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  34.38 
 
 		 590 aa  346  7e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  34.2 
 
 		 590 aa  346  8e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.77 
 
 		 595 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.37 
 
 		 587 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.12 
 
 		 587 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  34.37 
 
 		 605 aa  340  5.9999999999999996e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.89 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.65 
 
 		 582 aa  336  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.8 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.1 
 
 		 600 aa  329  9e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 604 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.13 
 
 		 595 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.03 
 
 		 626 aa  323  5e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.24 
 
 		 660 aa  323  8e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.8 
 
 		 660 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  39.95 
 
 		 638 aa  320  6e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.9 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.58 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.13 
 
 		 651 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.76 
 
 		 652 aa  317  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.94 
 
 		 655 aa  317  3e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.82 
 
 		 592 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.47 
 
 		 660 aa  316  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.61 
 
 		 663 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.8 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  38.25 
 
 		 617 aa  311  2e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.59 
 
 		 656 aa  310  4e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  34.88 
 
 		 588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.31 
 
 		 599 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.01 
 
 		 664 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.78 
 
 		 663 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.89 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  35.81 
 
 		 609 aa  303  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  34.74 
 
 		 584 aa  303  9e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.81 
 
 		 614 aa  302  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.7 
 
 		 599 aa  300  4e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  31.92 
 
 		 613 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.25 
 
 		 575 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.22 
 
 		 614 aa  299  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.58 
 
 		 601 aa  298  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  36.96 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  35.74 
 
 		 586 aa  298  3e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  36.3 
 
 		 666 aa  297  3e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  32.65 
 
 		 574 aa  297  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.72 
 
 		 619 aa  297  4e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  34.08 
 
 		 571 aa  297  5e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  32.39 
 
 		 582 aa  297  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  35.34 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.86 
 
 		 584 aa  296  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  37.02 
 
 		 603 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  35.05 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  36.41 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  36.41 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.45 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  36.41 
 
 		 582 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  35.27 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  34.42 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.02 
 
 		 584 aa  294  4e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.93 
 
 		 573 aa  293  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  32.2 
 
 		 574 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  31.8 
 
 		 575 aa  293  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  34.48 
 
 		 583 aa  293  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  38.73 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  33.75 
 
 		 576 aa  292  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  34.53 
 
 		 601 aa  292  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  34.86 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  34.86 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  33.54 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  34.86 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  34.86 
 
 		 581 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  37.77 
 
 		 645 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  31.09 
 
 		 574 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  36.07 
 
 		 603 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  37.39 
 
 		 653 aa  290  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  32.78 
 
 		 567 aa  290  8e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.84 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.54 
 
 		 581 aa  289  8e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  31.8 
 
 		 574 aa  290  8e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  32.4 
 
 		 582 aa  289  9e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.44 
 
 		 682 aa  289  9e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.84 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.84 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.84 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.84 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.84 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.84 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  30.92 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  33.86 
 
 		 574 aa  288  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  33.02 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.9 
 
 		 574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  31.66 
 
 		 576 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  36.26 
 
 		 660 aa  287  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>