More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2458 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  100 
 
 		 567 aa  1163    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  49.91 
 
 		 573 aa  536  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  49.24 
 
 		 572 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  45.74 
 
 		 576 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1086  DNA primase  47.24 
 
 		 580 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.115532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  44.95 
 
 		 599 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  45.53 
 
 		 638 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  40.85 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.56 
 
 		 660 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.7 
 
 		 593 aa  290  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.51 
 
 		 651 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.04 
 
 		 660 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.3 
 
 		 660 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.04 
 
 		 660 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  39.42 
 
 		 613 aa  287  5e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.51 
 
 		 655 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  40.6 
 
 		 617 aa  284  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.25 
 
 		 652 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.62 
 
 		 588 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.47 
 
 		 663 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.5 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.94 
 
 		 664 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.36 
 
 		 604 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.25 
 
 		 600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.01 
 
 		 592 aa  273  7e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  32.78 
 
 		 623 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.83 
 
 		 666 aa  269  8.999999999999999e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  34.59 
 
 		 584 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  40.62 
 
 		 640 aa  268  2.9999999999999995e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  38.1 
 
 		 576 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  37.77 
 
 		 575 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  40.6 
 
 		 613 aa  267  4e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  40.16 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.95 
 
 		 663 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  37.26 
 
 		 574 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2142  DNA primase  38.19 
 
 		 669 aa  264  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.512504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  37.75 
 
 		 574 aa  262  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.97 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.79 
 
 		 619 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  34.58 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  41.37 
 
 		 598 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  38.74 
 
 		 582 aa  261  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  36.49 
 
 		 576 aa  260  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  34.95 
 
 		 577 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.83 
 
 		 587 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  35.58 
 
 		 616 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  37.01 
 
 		 651 aa  259  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.97 
 
 		 584 aa  260  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  36.46 
 
 		 578 aa  260  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.05 
 
 		 611 aa  260  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  39.44 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  35.79 
 
 		 581 aa  259  7e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.28 
 
 		 601 aa  259  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.97 
 
 		 575 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  35.15 
 
 		 584 aa  259  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.5 
 
 		 601 aa  259  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  35.85 
 
 		 574 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  39.9 
 
 		 629 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  36.97 
 
 		 573 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  36.08 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  39.27 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  39.27 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  39.27 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.38 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  39.27 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.48 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  39.27 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  35.85 
 
 		 574 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  35.57 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  35.57 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  35.57 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  35.57 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  35.57 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  35.57 
 
 		 581 aa  258  3e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  35.35 
 
 		 652 aa  257  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.65 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.65 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  32.72 
 
 		 544 aa  257  4e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.65 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.36 
 
 		 605 aa  257  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  30.31 
 
 		 626 aa  257  4e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  33.05 
 
 		 588 aa  256  6e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.66 
 
 		 582 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.19 
 
 		 583 aa  256  9e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  39.89 
 
 		 645 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  35.61 
 
 		 574 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  43.44 
 
 		 587 aa  256  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  35.38 
 
 		 574 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  35.36 
 
 		 581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  35.36 
 
 		 581 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  34.67 
 
 		 658 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  37.38 
 
 		 624 aa  255  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  39.07 
 
 		 579 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  35.61 
 
 		 574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  39.15 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  32.49 
 
 		 599 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  34.46 
 
 		 583 aa  254  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.5 
 
 		 598 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  40.92 
 
 		 665 aa  253  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  37.96 
 
 		 614 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>