More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1727 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  100 
 
 		 611 aa  1212    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  41.14 
 
 		 599 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  43.62 
 
 		 599 aa  411  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  43.12 
 
 		 599 aa  381  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  37.4 
 
 		 626 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.4 
 
 		 605 aa  379  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  43.89 
 
 		 600 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  43.26 
 
 		 614 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.16 
 
 		 595 aa  360  5e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  38.37 
 
 		 601 aa  327  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.91 
 
 		 598 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  42.14 
 
 		 588 aa  326  9e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.39 
 
 		 593 aa  320  6e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  47.06 
 
 		 613 aa  319  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  39.15 
 
 		 544 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.7 
 
 		 617 aa  316  9e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.84 
 
 		 595 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.92 
 
 		 587 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36 
 
 		 604 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  43.05 
 
 		 595 aa  311  1e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  42.86 
 
 		 581 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.82 
 
 		 613 aa  309  8e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  42.22 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  42.22 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  42.22 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  42.22 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  42.22 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  42.22 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  42.59 
 
 		 582 aa  307  3e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  34.06 
 
 		 604 aa  308  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  42.59 
 
 		 582 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  42.59 
 
 		 582 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  42.22 
 
 		 581 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  39.91 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  39.91 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.47 
 
 		 601 aa  306  6e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  39.91 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  39.91 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  39.91 
 
 		 581 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.67 
 
 		 664 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  42.9 
 
 		 584 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  41.19 
 
 		 586 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  42.48 
 
 		 582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  41.95 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  41.95 
 
 		 581 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  46.58 
 
 		 614 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.67 
 
 		 663 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  42.36 
 
 		 584 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  35.39 
 
 		 605 aa  303  6.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  45.26 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  42.97 
 
 		 584 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.74 
 
 		 587 aa  301  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  48.4 
 
 		 577 aa  300  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  42.75 
 
 		 655 aa  300  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  43.6 
 
 		 638 aa  299  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  35.01 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  43.01 
 
 		 574 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.53 
 
 		 571 aa  298  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  41.94 
 
 		 576 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  43.01 
 
 		 574 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  33.81 
 
 		 584 aa  298  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  298  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  41.47 
 
 		 586 aa  297  4e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.8 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  42.74 
 
 		 574 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.53 
 
 		 598 aa  297  5e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.56 
 
 		 598 aa  296  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  42.74 
 
 		 574 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  43.01 
 
 		 574 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  44.87 
 
 		 617 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.34 
 
 		 609 aa  296  6e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.56 
 
 		 598 aa  296  7e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  37.84 
 
 		 590 aa  296  8e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  43.28 
 
 		 601 aa  296  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  41.82 
 
 		 572 aa  295  1e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  42.47 
 
 		 574 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  43.13 
 
 		 574 aa  296  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  43.12 
 
 		 660 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  43.28 
 
 		 575 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  42.74 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  42.06 
 
 		 651 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  42.47 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  42.74 
 
 		 574 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  33.56 
 
 		 588 aa  294  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  41.35 
 
 		 584 aa  294  4e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.86 
 
 		 660 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  44 
 
 		 582 aa  294  4e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  41.55 
 
 		 553 aa  294  4e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  38.77 
 
 		 645 aa  294  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.86 
 
 		 660 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.59 
 
 		 660 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  39.74 
 
 		 584 aa  293  9e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  44.12 
 
 		 564 aa  293  9e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  39.25 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  40.63 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>