More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0394 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  59.8 
 
 		 582 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  76.36 
 
 		 587 aa  911    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  100 
 
 		 588 aa  1186    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  59.45 
 
 		 583 aa  700    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  65.03 
 
 		 587 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  48.47 
 
 		 588 aa  571  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  48.14 
 
 		 584 aa  550  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  43.67 
 
 		 604 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.68 
 
 		 613 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.75 
 
 		 599 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.9 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.95 
 
 		 600 aa  350  3e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 604 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  45.5 
 
 		 599 aa  348  2e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.68 
 
 		 601 aa  346  8e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.71 
 
 		 605 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.69 
 
 		 652 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  41.46 
 
 		 651 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.81 
 
 		 619 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  39.25 
 
 		 636 aa  338  1.9999999999999998e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  41.45 
 
 		 604 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  32.35 
 
 		 626 aa  336  7.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  43.12 
 
 		 605 aa  335  1e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.01 
 
 		 660 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.46 
 
 		 655 aa  335  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  39.88 
 
 		 623 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  42.01 
 
 		 660 aa  333  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.06 
 
 		 638 aa  333  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.78 
 
 		 660 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  41.23 
 
 		 663 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.01 
 
 		 660 aa  332  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.36 
 
 		 595 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.91 
 
 		 664 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  38.03 
 
 		 598 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  38.24 
 
 		 674 aa  323  8e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  40.65 
 
 		 613 aa  323  8e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.36 
 
 		 663 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  40.27 
 
 		 646 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  40.27 
 
 		 646 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.33 
 
 		 617 aa  320  3e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.07 
 
 		 593 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.97 
 
 		 544 aa  319  9e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.38 
 
 		 703 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  39.07 
 
 		 660 aa  317  4e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  40.89 
 
 		 599 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  34.51 
 
 		 582 aa  316  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  37.79 
 
 		 653 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  41.73 
 
 		 611 aa  312  9e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  38.8 
 
 		 660 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  36.04 
 
 		 617 aa  310  5e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  38 
 
 		 579 aa  309  8e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  39.34 
 
 		 633 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.85 
 
 		 632 aa  309  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  35.9 
 
 		 704 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  32.31 
 
 		 596 aa  306  6e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  37.2 
 
 		 630 aa  306  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  37.35 
 
 		 592 aa  306  8.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  32.92 
 
 		 656 aa  305  1.0000000000000001e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.16 
 
 		 652 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  41 
 
 		 632 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.21 
 
 		 662 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  36.93 
 
 		 651 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.92 
 
 		 571 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.33 
 
 		 640 aa  303  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.75 
 
 		 600 aa  302  9e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  36.08 
 
 		 576 aa  302  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  38.87 
 
 		 614 aa  302  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  40.73 
 
 		 627 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  40 
 
 		 632 aa  302  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  38.86 
 
 		 694 aa  301  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38.05 
 
 		 656 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  36.79 
 
 		 640 aa  299  1e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  40.4 
 
 		 655 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.32 
 
 		 595 aa  297  3e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  36.05 
 
 		 636 aa  297  4e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.92 
 
 		 598 aa  297  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  36.67 
 
 		 640 aa  296  5e-79  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  34.01 
 
 		 639 aa  296  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  35.62 
 
 		 616 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.33 
 
 		 601 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  34.68 
 
 		 657 aa  296  8e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  36.73 
 
 		 675 aa  296  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.08 
 
 		 595 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  36.91 
 
 		 676 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  33.87 
 
 		 624 aa  295  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  34.3 
 
 		 673 aa  294  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  33.88 
 
 		 586 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  37.69 
 
 		 577 aa  293  5e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  38.81 
 
 		 679 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.82 
 
 		 574 aa  293  7e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.71 
 
 		 660 aa  293  9e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  39.34 
 
 		 631 aa  292  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>