More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0491 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  100 
 
 		 599 aa  1222    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  46.91 
 
 		 604 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  46.57 
 
 		 599 aa  548  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.62 
 
 		 611 aa  415  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.02 
 
 		 605 aa  411  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.51 
 
 		 600 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.7 
 
 		 614 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.63 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  45.08 
 
 		 599 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.41 
 
 		 626 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  41.51 
 
 		 604 aa  369  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  44.6 
 
 		 587 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.73 
 
 		 601 aa  365  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  45.5 
 
 		 588 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  43.81 
 
 		 587 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  49.04 
 
 		 595 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  43.41 
 
 		 583 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  49.32 
 
 		 595 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  43.56 
 
 		 582 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  42.52 
 
 		 584 aa  349  8e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.98 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  38.82 
 
 		 598 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  38.82 
 
 		 598 aa  342  9e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  38.82 
 
 		 571 aa  342  1e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  38.82 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  38.82 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  38.82 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  38.82 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.41 
 
 		 600 aa  341  2e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38.59 
 
 		 598 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38.59 
 
 		 598 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.89 
 
 		 544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.33 
 
 		 598 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.46 
 
 		 593 aa  335  2e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  42.52 
 
 		 663 aa  332  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  43.93 
 
 		 664 aa  330  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  43.77 
 
 		 655 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.44 
 
 		 613 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.99 
 
 		 601 aa  327  4.0000000000000003e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  42.89 
 
 		 651 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  46.54 
 
 		 613 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  45.17 
 
 		 638 aa  324  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  43.45 
 
 		 663 aa  323  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  42.75 
 
 		 660 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  43 
 
 		 660 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  42.75 
 
 		 652 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  42.65 
 
 		 660 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  39.21 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  42.65 
 
 		 660 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  40.48 
 
 		 588 aa  318  1e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  39.67 
 
 		 660 aa  317  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  33.72 
 
 		 617 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.21 
 
 		 632 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  38.65 
 
 		 646 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  38.65 
 
 		 646 aa  315  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  43.32 
 
 		 576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  42.96 
 
 		 614 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  37.74 
 
 		 686 aa  313  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  40 
 
 		 675 aa  313  4.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.24 
 
 		 619 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  39.53 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.96 
 
 		 604 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  34.1 
 
 		 596 aa  311  2.9999999999999997e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  32.38 
 
 		 606 aa  310  5.9999999999999995e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  42.33 
 
 		 601 aa  309  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  44.19 
 
 		 660 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  38.31 
 
 		 682 aa  308  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  31.07 
 
 		 598 aa  308  3e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  42.33 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  39.45 
 
 		 652 aa  307  3e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  39.95 
 
 		 590 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  40.21 
 
 		 590 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  39.32 
 
 		 662 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  37.26 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  41.8 
 
 		 574 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  40.86 
 
 		 577 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  41.53 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  41.53 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  41.53 
 
 		 575 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  41.8 
 
 		 574 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  42.59 
 
 		 576 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  32.41 
 
 		 656 aa  302  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.86 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  42.36 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  41.62 
 
 		 575 aa  302  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  39.45 
 
 		 651 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  41.53 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  39.31 
 
 		 631 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  37.7 
 
 		 623 aa  301  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  41.53 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  41.53 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  41.53 
 
 		 574 aa  301  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  39.54 
 
 		 576 aa  300  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  36.56 
 
 		 655 aa  300  4e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.66 
 
 		 656 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  41.27 
 
 		 574 aa  299  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  38.9 
 
 		 588 aa  299  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  38.57 
 
 		 703 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  37.18 
 
 		 679 aa  298  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.13 
 
 		 674 aa  296  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>