More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0959 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  80.14 
 
 
574 aa  955    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  85.37 
 
 
573 aa  1008    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  79.09 
 
 
574 aa  930    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  80.31 
 
 
574 aa  955    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  74.61 
 
 
576 aa  870    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  82.99 
 
 
601 aa  992    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  80.14 
 
 
574 aa  954    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  85.51 
 
 
575 aa  1019    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  76.66 
 
 
574 aa  923    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  80.31 
 
 
574 aa  955    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  78.57 
 
 
574 aa  929    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  79.27 
 
 
574 aa  934    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  77.95 
 
 
575 aa  934    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  100 
 
 
576 aa  1186    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  80.14 
 
 
574 aa  936    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  78.57 
 
 
574 aa  924    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  51.37 
 
 
586 aa  590  1e-167  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  51.64 
 
 
582 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  50.86 
 
 
588 aa  585  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  52.17 
 
 
581 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  52.23 
 
 
584 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  51.13 
 
 
581 aa  580  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  53.14 
 
 
584 aa  579  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  51.83 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  51.83 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  51.13 
 
 
582 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  51.83 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  50.6 
 
 
609 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  51.83 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  51.13 
 
 
582 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  51.65 
 
 
581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  51.13 
 
 
582 aa  578  1.0000000000000001e-163  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  51.65 
 
 
581 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  51.83 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  51.83 
 
 
581 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  51.71 
 
 
584 aa  574  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  50.6 
 
 
584 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  51.3 
 
 
581 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  51.3 
 
 
581 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  51.3 
 
 
581 aa  565  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  48.54 
 
 
585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  49.32 
 
 
586 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  51.3 
 
 
581 aa  565  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  51.13 
 
 
581 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  48.88 
 
 
584 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  49.48 
 
 
583 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  48.9 
 
 
588 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  44.93 
 
 
574 aa  486  1e-136  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0617  DNA primase  44.16 
 
 
595 aa  486  1e-136  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.912448  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  45.14 
 
 
577 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  45.9 
 
 
617 aa  468  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  44.37 
 
 
578 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  43.52 
 
 
582 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.3 
 
 
660 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  54.74 
 
 
660 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.96 
 
 
638 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  51.81 
 
 
652 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.31 
 
 
651 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  54.26 
 
 
660 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  51.57 
 
 
656 aa  456  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  52.01 
 
 
663 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  54.01 
 
 
660 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  52.53 
 
 
655 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  52.13 
 
 
663 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  43.67 
 
 
579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  51.77 
 
 
664 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  41.95 
 
 
572 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  41.95 
 
 
553 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  43.37 
 
 
614 aa  436  1e-121  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  41.37 
 
 
571 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  42 
 
 
577 aa  436  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  43.39 
 
 
577 aa  438  1e-121  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  53.87 
 
 
576 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  50.72 
 
 
666 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  46.5 
 
 
592 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  42.16 
 
 
613 aa  427  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  40.96 
 
 
565 aa  412  1e-114  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  49.07 
 
 
576 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  45.92 
 
 
645 aa  396  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  44.31 
 
 
578 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  39.39 
 
 
594 aa  395  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  46.58 
 
 
631 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  48.07 
 
 
559 aa  386  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  45.11 
 
 
598 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  46.6 
 
 
652 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  45 
 
 
660 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  43.64 
 
 
676 aa  368  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  42.74 
 
 
625 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  42.74 
 
 
625 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  42.92 
 
 
622 aa  362  9e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  42.3 
 
 
622 aa  361  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  42.74 
 
 
800 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  42.39 
 
 
638 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  45.24 
 
 
636 aa  359  8e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  42.29 
 
 
677 aa  356  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  48.84 
 
 
603 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  48.84 
 
 
603 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  43.48 
 
 
659 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  49.35 
 
 
613 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  43.89 
 
 
603 aa  351  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>