More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12410 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  100 
 
 		 599 aa  1214    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  44.66 
 
 		 600 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  43.92 
 
 		 626 aa  423  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  47.56 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 604 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  41.72 
 
 		 601 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.09 
 
 		 599 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.36 
 
 		 605 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  45.08 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  43.37 
 
 		 619 aa  371  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  42.09 
 
 		 601 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  44.17 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  41.21 
 
 		 614 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  44.07 
 
 		 595 aa  363  5.0000000000000005e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.75 
 
 		 588 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  44.07 
 
 		 595 aa  361  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  42.79 
 
 		 604 aa  361  3e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.32 
 
 		 613 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  41.01 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.08 
 
 		 596 aa  353  5e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  40.8 
 
 		 600 aa  350  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  36.11 
 
 		 587 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  41.23 
 
 		 571 aa  349  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  349  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  349  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  38.8 
 
 		 593 aa  346  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  40.42 
 
 		 598 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  39.87 
 
 		 703 aa  343  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  39.41 
 
 		 636 aa  342  9e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  40.81 
 
 		 544 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  41.5 
 
 		 587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  34.57 
 
 		 652 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  39.44 
 
 		 632 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  42.23 
 
 		 674 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.21 
 
 		 583 aa  332  9e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  36.56 
 
 		 632 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.07 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  39.76 
 
 		 660 aa  330  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  34.44 
 
 		 623 aa  329  8e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  39.44 
 
 		 653 aa  329  9e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  43.12 
 
 		 577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  38.58 
 
 		 660 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.84 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  42.62 
 
 		 591 aa  327  5e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  40.77 
 
 		 631 aa  327  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  35.07 
 
 		 651 aa  326  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  37.97 
 
 		 640 aa  325  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  40.9 
 
 		 604 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.76 
 
 		 633 aa  325  2e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.58 
 
 		 660 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.95 
 
 		 660 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  40.74 
 
 		 663 aa  324  3e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.73 
 
 		 660 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  41.26 
 
 		 617 aa  324  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  40.05 
 
 		 621 aa  323  5e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  39.44 
 
 		 640 aa  323  6e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  42.92 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.15 
 
 		 656 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  41.71 
 
 		 664 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.23 
 
 		 638 aa  321  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.49 
 
 		 655 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  41.81 
 
 		 646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  41.81 
 
 		 646 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.86 
 
 		 663 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  39.49 
 
 		 662 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.68 
 
 		 601 aa  317  3e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  39.25 
 
 		 598 aa  317  4e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  37.53 
 
 		 656 aa  317  4e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.31 
 
 		 666 aa  317  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  39.73 
 
 		 630 aa  317  5e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  37.47 
 
 		 686 aa  316  6e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  40.05 
 
 		 660 aa  316  6e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.07 
 
 		 682 aa  315  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  37.25 
 
 		 636 aa  315  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.49 
 
 		 651 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  40.71 
 
 		 684 aa  313  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.15 
 
 		 660 aa  313  5.999999999999999e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  36.62 
 
 		 564 aa  312  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  35.48 
 
 		 676 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  33.93 
 
 		 645 aa  311  2.9999999999999997e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40 
 
 		 652 aa  310  4e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.18 
 
 		 613 aa  310  5.9999999999999995e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  39.09 
 
 		 617 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  36.73 
 
 		 602 aa  308  2.0000000000000002e-82  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  38.24 
 
 		 606 aa  308  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  37.75 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  36.7 
 
 		 673 aa  307  4.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  33.39 
 
 		 574 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  40.1 
 
 		 694 aa  306  8.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  38.08 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  34.64 
 
 		 655 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  38.08 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  42.78 
 
 		 574 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  37.99 
 
 		 590 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>