More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4217 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  100 
 
 		 614 aa  1269    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.48 
 
 		 604 aa  419  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.37 
 
 		 599 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.36 
 
 		 599 aa  382  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.76 
 
 		 601 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  40.64 
 
 		 626 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.2 
 
 		 600 aa  369  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.44 
 
 		 605 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.89 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  42.23 
 
 		 587 aa  363  4e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  41.9 
 
 		 588 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.4 
 
 		 598 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  43.26 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  40.93 
 
 		 582 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  41.06 
 
 		 600 aa  346  8.999999999999999e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  42.54 
 
 		 595 aa  346  8.999999999999999e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  41.63 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  41.63 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  41.63 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  41.63 
 
 		 598 aa  344  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.24 
 
 		 604 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  41.24 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  41.63 
 
 		 598 aa  345  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  41.24 
 
 		 598 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  41.43 
 
 		 583 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  41.38 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  40.52 
 
 		 593 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  41.01 
 
 		 598 aa  343  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.69 
 
 		 587 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.24 
 
 		 613 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  41.19 
 
 		 598 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  40.41 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  40.33 
 
 		 588 aa  334  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.92 
 
 		 595 aa  333  8e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.23 
 
 		 604 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.68 
 
 		 595 aa  330  4e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39.26 
 
 		 584 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  33.8 
 
 		 596 aa  329  7e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.93 
 
 		 619 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  38.2 
 
 		 636 aa  312  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  37.64 
 
 		 660 aa  310  5e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  38.27 
 
 		 662 aa  310  5e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.15 
 
 		 578 aa  307  3e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.51 
 
 		 653 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  41.77 
 
 		 605 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.1 
 
 		 703 aa  306  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  40.65 
 
 		 582 aa  303  8.000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  39.49 
 
 		 588 aa  302  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38.75 
 
 		 632 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  40.54 
 
 		 584 aa  300  4e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  37.6 
 
 		 630 aa  300  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  39.6 
 
 		 633 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  40.65 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  38.55 
 
 		 590 aa  300  7e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  37.44 
 
 		 621 aa  300  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  40.65 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.15 
 
 		 655 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  37.16 
 
 		 645 aa  298  3e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  39.86 
 
 		 584 aa  297  4e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  38.95 
 
 		 577 aa  296  6e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  40.18 
 
 		 581 aa  296  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.79 
 
 		 660 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  38.69 
 
 		 646 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  40.42 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  38.69 
 
 		 646 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  40.47 
 
 		 660 aa  295  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  38.44 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.03 
 
 		 660 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  38.44 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  38.44 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  38.44 
 
 		 581 aa  295  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  38.55 
 
 		 590 aa  294  3e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  38.55 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  39.05 
 
 		 584 aa  294  3e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  40.21 
 
 		 676 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.51 
 
 		 652 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.59 
 
 		 591 aa  293  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.79 
 
 		 660 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  39.73 
 
 		 584 aa  293  6e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.54 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  39.61 
 
 		 674 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.81 
 
 		 656 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.57 
 
 		 544 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  39.5 
 
 		 632 aa  291  2e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  38.84 
 
 		 686 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  39.9 
 
 		 617 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  37.45 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.33 
 
 		 601 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.41 
 
 		 651 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  41.23 
 
 		 598 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  38.48 
 
 		 576 aa  288  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  38.7 
 
 		 675 aa  288  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.41 
 
 		 663 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  40.43 
 
 		 617 aa  288  2.9999999999999996e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>