More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1978 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  100 
 
 		 601 aa  1229    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.33 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.33 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.33 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.33 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.33 
 
 		 598 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.76 
 
 		 571 aa  415  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39 
 
 		 598 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.17 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.17 
 
 		 598 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.91 
 
 		 598 aa  410  1e-113  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  38.61 
 
 		 600 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  38.87 
 
 		 601 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  41.48 
 
 		 598 aa  380  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 604 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  42.09 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  39.95 
 
 		 626 aa  357  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  32.56 
 
 		 595 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.97 
 
 		 605 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  35.69 
 
 		 599 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  36.73 
 
 		 599 aa  347  3e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  33.39 
 
 		 600 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  39.47 
 
 		 621 aa  336  5.999999999999999e-91  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  40.41 
 
 		 614 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39.29 
 
 		 604 aa  333  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  34.93 
 
 		 632 aa  324  2e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  32.39 
 
 		 606 aa  324  3e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  34.27 
 
 		 636 aa  321  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  33.1 
 
 		 595 aa  320  5e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  32.93 
 
 		 595 aa  316  8e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  37.46 
 
 		 611 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  38 
 
 		 544 aa  313  4.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  44.99 
 
 		 614 aa  313  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  42.7 
 
 		 577 aa  311  2e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  34.49 
 
 		 630 aa  311  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.41 
 
 		 619 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  34.22 
 
 		 660 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  35.77 
 
 		 632 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  30.38 
 
 		 598 aa  306  9.000000000000001e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  42.44 
 
 		 565 aa  304  4.0000000000000003e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  34.49 
 
 		 633 aa  301  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.52 
 
 		 613 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  34.34 
 
 		 593 aa  301  3e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0264  DNA primase  36.17 
 
 		 594 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.822275  normal  0.137236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.34 
 
 		 582 aa  298  2e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  38.92 
 
 		 592 aa  297  3e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  34.75 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.06 
 
 		 587 aa  296  6e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.24 
 
 		 583 aa  296  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  36.15 
 
 		 703 aa  294  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  44.77 
 
 		 617 aa  294  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  37.98 
 
 		 584 aa  293  6e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  37.31 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.52 
 
 		 575 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  37.77 
 
 		 584 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.52 
 
 		 663 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37 
 
 		 588 aa  291  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.21 
 
 		 655 aa  289  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.34 
 
 		 604 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  38.31 
 
 		 631 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1464  DNA primase  40.83 
 
 		 639 aa  289  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.95 
 
 		 651 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.85 
 
 		 660 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  38.67 
 
 		 605 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  40.29 
 
 		 579 aa  287  2.9999999999999996e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  37.61 
 
 		 655 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.22 
 
 		 664 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  38.61 
 
 		 660 aa  287  4e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.19 
 
 		 578 aa  287  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  33.02 
 
 		 584 aa  287  4e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  37.39 
 
 		 598 aa  286  5e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  42.17 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  31.91 
 
 		 596 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  38.61 
 
 		 660 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  32.5 
 
 		 588 aa  286  8e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  39.18 
 
 		 652 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  34.26 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  41.99 
 
 		 684 aa  286  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  38.43 
 
 		 652 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  38.61 
 
 		 660 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  34.26 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  35.28 
 
 		 590 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  42.11 
 
 		 682 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.98 
 
 		 587 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  34.92 
 
 		 576 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  30.64 
 
 		 610 aa  285  2.0000000000000002e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  44.13 
 
 		 638 aa  284  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.54 
 
 		 573 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  34.35 
 
 		 585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  32.2 
 
 		 590 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  42.33 
 
 		 631 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  34.11 
 
 		 609 aa  283  6.000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  35.83 
 
 		 586 aa  283  7.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.93 
 
 		 662 aa  282  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  42.52 
 
 		 613 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  40.32 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1480  DNA primase  42.71 
 
 		 655 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  44.07 
 
 		 564 aa  281  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  41.01 
 
 		 686 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1686  DNA primase  42.46 
 
 		 656 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.481097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>