More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1964 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  100 
 
 		 632 aa  1302    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  62.97 
 
 		 633 aa  813    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  58.44 
 
 		 660 aa  781    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  54.42 
 
 		 632 aa  724    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  53.3 
 
 		 630 aa  682    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  62.82 
 
 		 631 aa  810    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  62.66 
 
 		 636 aa  853    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.65 
 
 		 619 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  39.5 
 
 		 656 aa  348  3e-94  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  36.56 
 
 		 599 aa  347  5e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  43.09 
 
 		 704 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  38.98 
 
 		 657 aa  327  4.0000000000000003e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.45 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  41.51 
 
 		 703 aa  325  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.6 
 
 		 583 aa  324  3e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.42 
 
 		 582 aa  323  5e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  35.77 
 
 		 601 aa  322  9.999999999999999e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  37.88 
 
 		 593 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.47 
 
 		 587 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.63 
 
 		 598 aa  320  5e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  39.73 
 
 		 660 aa  320  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  40 
 
 		 588 aa  320  6e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  39.02 
 
 		 600 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  39.63 
 
 		 571 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  32.28 
 
 		 640 aa  319  1e-85  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  32.68 
 
 		 653 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.64 
 
 		 587 aa  318  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.56 
 
 		 600 aa  314  3.9999999999999997e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  37.79 
 
 		 626 aa  310  4e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.28 
 
 		 613 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  32.5 
 
 		 673 aa  308  1.0000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.03 
 
 		 598 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.55 
 
 		 663 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 604 aa  306  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41 
 
 		 638 aa  306  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.5 
 
 		 614 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.56 
 
 		 601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.96 
 
 		 588 aa  301  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  39.43 
 
 		 663 aa  301  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.81 
 
 		 655 aa  300  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.59 
 
 		 662 aa  300  7e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  43.09 
 
 		 664 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.64 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  44.17 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  36.77 
 
 		 674 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.67 
 
 		 660 aa  296  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.96 
 
 		 584 aa  296  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.69 
 
 		 604 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.7 
 
 		 660 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.88 
 
 		 651 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.44 
 
 		 660 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.14 
 
 		 595 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.14 
 
 		 595 aa  293  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.63 
 
 		 660 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.52 
 
 		 652 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.6 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  42.09 
 
 		 544 aa  288  2e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  38.65 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  38.62 
 
 		 613 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  35.83 
 
 		 678 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.9 
 
 		 656 aa  282  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  41.85 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  39.95 
 
 		 666 aa  281  3e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  38.63 
 
 		 682 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  38.39 
 
 		 684 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  38.63 
 
 		 686 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.41 
 
 		 591 aa  279  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.97 
 
 		 598 aa  276  6e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.32 
 
 		 598 aa  276  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  38.84 
 
 		 694 aa  274  3e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  34.1 
 
 		 617 aa  275  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.44 
 
 		 646 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.44 
 
 		 646 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  42.66 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  33.57 
 
 		 611 aa  271  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  38.66 
 
 		 639 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.67 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.96 
 
 		 585 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  38.94 
 
 		 576 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  32.44 
 
 		 599 aa  270  5.9999999999999995e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  35.04 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  31.89 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  31.89 
 
 		 605 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  42.11 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1807  DNA primase  42.11 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  34.64 
 
 		 677 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  37.35 
 
 		 586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  35.59 
 
 		 588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  36.62 
 
 		 584 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  36.62 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.48 
 
 		 601 aa  267  4e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  35.78 
 
 		 675 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  37.02 
 
 		 601 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>