More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0548 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  60.7 
 
 		 631 aa  790    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  51.69 
 
 		 632 aa  668    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  58.75 
 
 		 633 aa  776    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  100 
 
 		 660 aa  1362    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  50.08 
 
 		 630 aa  654    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  58.44 
 
 		 632 aa  756    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  57.49 
 
 		 636 aa  769    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.39 
 
 		 619 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.76 
 
 		 599 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  36.36 
 
 		 656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  33.85 
 
 		 704 aa  320  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  39.95 
 
 		 600 aa  320  7e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  36.67 
 
 		 582 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  37 
 
 		 673 aa  311  2e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.8 
 
 		 583 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.27 
 
 		 587 aa  311  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  38.8 
 
 		 588 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  38.43 
 
 		 657 aa  310  6.999999999999999e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.99 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  38.04 
 
 		 653 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.22 
 
 		 601 aa  308  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.84 
 
 		 614 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  40.43 
 
 		 660 aa  306  6e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  31.84 
 
 		 640 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.62 
 
 		 600 aa  306  9.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  35.51 
 
 		 703 aa  304  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.67 
 
 		 599 aa  301  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  4e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  39.16 
 
 		 613 aa  300  5e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  300  6e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  35.71 
 
 		 674 aa  300  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.81 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.74 
 
 		 604 aa  299  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.53 
 
 		 595 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  37.79 
 
 		 571 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  37.56 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 604 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.03 
 
 		 598 aa  294  4e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.99 
 
 		 588 aa  293  6e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  35.53 
 
 		 626 aa  293  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  39.12 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.95 
 
 		 662 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  40.65 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  40.33 
 
 		 595 aa  292  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  37.35 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  35.7 
 
 		 663 aa  288  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  35.07 
 
 		 593 aa  286  8e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.44 
 
 		 660 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  35.98 
 
 		 656 aa  286  1.0000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.44 
 
 		 660 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  38.27 
 
 		 651 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.14 
 
 		 652 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.92 
 
 		 660 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.93 
 
 		 638 aa  282  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  37.79 
 
 		 684 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  39.95 
 
 		 611 aa  282  2e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  38.5 
 
 		 686 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  38.73 
 
 		 682 aa  281  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  36.71 
 
 		 660 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.76 
 
 		 655 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.47 
 
 		 663 aa  280  6e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  37.91 
 
 		 604 aa  278  2e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.5 
 
 		 664 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  41.62 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.96 
 
 		 584 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.24 
 
 		 605 aa  276  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  42.39 
 
 		 577 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  36.42 
 
 		 640 aa  276  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.95 
 
 		 598 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.26 
 
 		 596 aa  273  7e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  36.68 
 
 		 579 aa  273  8.000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  40.79 
 
 		 601 aa  273  9e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  35.74 
 
 		 646 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  33.52 
 
 		 613 aa  271  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  35.74 
 
 		 646 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  36.52 
 
 		 591 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  36.32 
 
 		 666 aa  271  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  35.52 
 
 		 617 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  38.22 
 
 		 539 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.59 
 
 		 582 aa  267  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  31.94 
 
 		 585 aa  266  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  35.73 
 
 		 614 aa  265  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37.06 
 
 		 694 aa  265  3e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.18 
 
 		 588 aa  263  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  31.73 
 
 		 584 aa  262  1e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0806  DNA primase  34.79 
 
 		 639 aa  263  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  33.72 
 
 		 678 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  35.38 
 
 		 647 aa  262  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  39.3 
 
 		 586 aa  261  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  37.62 
 
 		 629 aa  260  6e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  38.95 
 
 		 583 aa  260  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  38.95 
 
 		 583 aa  260  7e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34.39 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1739  DNA primase  34.9 
 
 		 577 aa  259  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.13 
 
 		 581 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>