More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1589 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  53.02 
 
 		 632 aa  673    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  66.35 
 
 		 631 aa  830    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  100 
 
 		 633 aa  1298    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  59.21 
 
 		 660 aa  777    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  62.66 
 
 		 632 aa  788    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  51.81 
 
 		 630 aa  648    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  61.39 
 
 		 636 aa  806    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.59 
 
 		 619 aa  355  2e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.76 
 
 		 599 aa  324  3e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  37.86 
 
 		 583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.63 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  38.08 
 
 		 582 aa  317  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  39.8 
 
 		 595 aa  316  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  38 
 
 		 598 aa  310  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.86 
 
 		 588 aa  309  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.1 
 
 		 587 aa  309  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  38 
 
 		 571 aa  309  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.76 
 
 		 600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  38.69 
 
 		 613 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  37.88 
 
 		 704 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.34 
 
 		 601 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  38.55 
 
 		 656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.37 
 
 		 601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  32.38 
 
 		 640 aa  303  7.000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  37.79 
 
 		 598 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.68 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  38.6 
 
 		 626 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  37.41 
 
 		 653 aa  300  7e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.6 
 
 		 614 aa  299  8e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  35.46 
 
 		 657 aa  296  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  39.02 
 
 		 595 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.02 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  38.52 
 
 		 660 aa  294  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.21 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  38.81 
 
 		 703 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  38.41 
 
 		 604 aa  291  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.23 
 
 		 593 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.42 
 
 		 604 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.94 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  36.53 
 
 		 674 aa  286  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  42.66 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  37.76 
 
 		 663 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.58 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 604 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.32 
 
 		 638 aa  280  5e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.03 
 
 		 663 aa  280  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.53 
 
 		 660 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  40.85 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.77 
 
 		 664 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  37.41 
 
 		 591 aa  278  3e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  37.74 
 
 		 694 aa  277  5e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.87 
 
 		 651 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  40.32 
 
 		 660 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.05 
 
 		 660 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.92 
 
 		 655 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.42 
 
 		 652 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  37.44 
 
 		 684 aa  273  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  35.2 
 
 		 639 aa  273  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  32.97 
 
 		 601 aa  273  7e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  31.92 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.55 
 
 		 598 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.54 
 
 		 599 aa  272  2e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  38.15 
 
 		 686 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  33.87 
 
 		 662 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  36.04 
 
 		 605 aa  268  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  37.44 
 
 		 682 aa  267  5e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10221  DNA primase  35.85 
 
 		 678 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.081725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.16 
 
 		 666 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  37.53 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  37.53 
 
 		 646 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.59 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  34.32 
 
 		 578 aa  263  4.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  34.07 
 
 		 673 aa  263  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  35.38 
 
 		 617 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.92 
 
 		 611 aa  259  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  42.34 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.64 
 
 		 613 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  38.89 
 
 		 656 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  39.66 
 
 		 640 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  40.82 
 
 		 577 aa  257  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  40.35 
 
 		 564 aa  257  4e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  38.14 
 
 		 605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  38.12 
 
 		 601 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  35.73 
 
 		 599 aa  255  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  35.98 
 
 		 623 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.82 
 
 		 592 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  35.58 
 
 		 679 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.62 
 
 		 675 aa  254  3e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  38.97 
 
 		 539 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  37.56 
 
 		 606 aa  253  6e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09211  DNA primase  35.46 
 
 		 677 aa  253  7e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0860  DNA primase  35.46 
 
 		 677 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.262059  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  40.22 
 
 		 576 aa  252  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>