More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6451 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  100 
 
 		 662 aa  1373    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  41.81 
 
 		 674 aa  522  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  41.69 
 
 		 653 aa  511  1e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  40.2 
 
 		 660 aa  505  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  45.94 
 
 		 656 aa  491  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  39.43 
 
 		 640 aa  479  1e-134  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  39 
 
 		 703 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  49.11 
 
 		 704 aa  475  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  43.42 
 
 		 673 aa  445  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  47.32 
 
 		 657 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  42.73 
 
 		 619 aa  369  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.2 
 
 		 595 aa  326  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  33.21 
 
 		 601 aa  320  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  38.36 
 
 		 599 aa  320  7.999999999999999e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  36.9 
 
 		 600 aa  316  9e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.25 
 
 		 598 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.73 
 
 		 571 aa  312  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.65 
 
 		 598 aa  312  2e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.51 
 
 		 598 aa  312  2e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.51 
 
 		 598 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.51 
 
 		 598 aa  312  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.65 
 
 		 598 aa  312  2e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.27 
 
 		 614 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.9 
 
 		 598 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.76 
 
 		 598 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.51 
 
 		 598 aa  310  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  37.21 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  37.29 
 
 		 636 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.19 
 
 		 626 aa  305  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.67 
 
 		 598 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.67 
 
 		 605 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  36.21 
 
 		 588 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 604 aa  303  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  34.58 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.1 
 
 		 588 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.36 
 
 		 600 aa  294  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  36.95 
 
 		 660 aa  293  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.46 
 
 		 587 aa  293  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  34.48 
 
 		 583 aa  293  7e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  37.53 
 
 		 539 aa  293  8e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  36.71 
 
 		 632 aa  291  3e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  39.95 
 
 		 660 aa  290  5.0000000000000004e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  37.59 
 
 		 596 aa  290  8e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  39.37 
 
 		 676 aa  288  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  34.93 
 
 		 599 aa  287  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  35.52 
 
 		 630 aa  286  5.999999999999999e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  39.32 
 
 		 599 aa  286  8e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  38.05 
 
 		 617 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  35.93 
 
 		 593 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  36.6 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  36.59 
 
 		 632 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.71 
 
 		 605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.71 
 
 		 605 aa  284  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  40.37 
 
 		 645 aa  284  4.0000000000000003e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  35.89 
 
 		 604 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  36.93 
 
 		 601 aa  282  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  31.31 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.04 
 
 		 544 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  35.39 
 
 		 584 aa  281  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  41.01 
 
 		 611 aa  280  4e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  33.79 
 
 		 613 aa  281  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  36.68 
 
 		 646 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  36.68 
 
 		 646 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.83 
 
 		 595 aa  279  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.65 
 
 		 663 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.65 
 
 		 664 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  39.73 
 
 		 598 aa  276  7e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.59 
 
 		 595 aa  276  7e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  40.65 
 
 		 656 aa  276  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  35 
 
 		 636 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  35.01 
 
 		 631 aa  273  8.000000000000001e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  39.3 
 
 		 694 aa  273  9e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  36.85 
 
 		 588 aa  273  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  33.83 
 
 		 684 aa  270  7e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  40.05 
 
 		 586 aa  269  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  35.22 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  33.87 
 
 		 633 aa  269  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  32.83 
 
 		 677 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  39.36 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  36.2 
 
 		 659 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  35.28 
 
 		 675 aa  269  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.43 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.52 
 
 		 663 aa  268  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  31.6 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  39.89 
 
 		 576 aa  267  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.74 
 
 		 604 aa  266  8e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  39.78 
 
 		 588 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  34.63 
 
 		 655 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  34.48 
 
 		 660 aa  266  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  34.48 
 
 		 660 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  33.86 
 
 		 666 aa  265  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.98 
 
 		 675 aa  265  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  36.19 
 
 		 638 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  38.79 
 
 		 622 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  34.92 
 
 		 640 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  38.61 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  38.61 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  36.83 
 
 		 585 aa  263  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  38.79 
 
 		 622 aa  263  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  34.24 
 
 		 652 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>