More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1316 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1316  DNA primase  100 
 
 
577 aa  1165    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.241058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  43.12 
 
 
599 aa  338  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  43.32 
 
 
593 aa  337  5e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  42.7 
 
 
601 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  42.17 
 
 
605 aa  317  5e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  39.22 
 
 
626 aa  309  8e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  41.08 
 
 
600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  43.65 
 
 
595 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  47.81 
 
 
611 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  42.69 
 
 
604 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  39.26 
 
 
595 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  39.74 
 
 
614 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  43.21 
 
 
601 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  42.75 
 
 
599 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  39.87 
 
 
604 aa  300  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.43 
 
 
595 aa  299  9e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.85 
 
 
571 aa  297  4e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.85 
 
 
598 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.85 
 
 
598 aa  297  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.85 
 
 
598 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.85 
 
 
598 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.85 
 
 
598 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  35.85 
 
 
598 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35 
 
 
600 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  40.86 
 
 
599 aa  295  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  39.19 
 
 
596 aa  295  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  34.89 
 
 
598 aa  294  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  34.89 
 
 
598 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  34.52 
 
 
598 aa  293  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  41.46 
 
 
578 aa  293  7e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.7 
 
 
613 aa  292  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  41.76 
 
 
573 aa  292  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.87 
 
 
587 aa  290  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  40.73 
 
 
645 aa  287  2.9999999999999996e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  34.91 
 
 
604 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  41.94 
 
 
675 aa  284  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  36.94 
 
 
652 aa  284  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  39.62 
 
 
636 aa  284  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  35 
 
 
564 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0462  DNA primase  42.02 
 
 
559 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  40.25 
 
 
636 aa  282  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  40.27 
 
 
598 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  42.39 
 
 
660 aa  282  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0659  DNA primase  38.31 
 
 
583 aa  278  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.250836  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.71 
 
 
686 aa  277  4e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  37.88 
 
 
632 aa  276  5e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.67 
 
 
586 aa  276  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  38.74 
 
 
619 aa  276  6e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  37.65 
 
 
606 aa  276  6e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  41.21 
 
 
544 aa  276  7e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.41 
 
 
584 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  39.64 
 
 
676 aa  276  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  39.89 
 
 
588 aa  276  8e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  36.23 
 
 
598 aa  276  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  38.59 
 
 
640 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.82 
 
 
660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.55 
 
 
660 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  40.16 
 
 
590 aa  274  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.92 
 
 
588 aa  273  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.78 
 
 
638 aa  273  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  41.6 
 
 
656 aa  272  9e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  41.73 
 
 
617 aa  273  9e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  41.04 
 
 
652 aa  272  1e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  35.47 
 
 
684 aa  272  1e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  35.76 
 
 
662 aa  272  1e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  41.29 
 
 
660 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  41.85 
 
 
632 aa  271  2e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  34.07 
 
 
682 aa  272  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  40.91 
 
 
660 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1030  DNA primase  37.56 
 
 
530 aa  271  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5107  DNA primase  40.05 
 
 
634 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0326  DNA primase  39.53 
 
 
539 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.34 
 
 
660 aa  270  5e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  39.34 
 
 
590 aa  270  5e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  270  7e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  270  7e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.21 
 
 
655 aa  269  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0712  DNA primase  37.1 
 
 
617 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  269  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  31.24 
 
 
588 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  38.3 
 
 
694 aa  269  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  42.37 
 
 
581 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  42.37 
 
 
581 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  40.37 
 
 
631 aa  269  1e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.21 
 
 
609 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  41.83 
 
 
646 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  38.11 
 
 
630 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2944  DNA primase  38.11 
 
 
591 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0197074  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  41.83 
 
 
646 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  33.75 
 
 
601 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  35.2 
 
 
567 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.16 
 
 
605 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.16 
 
 
605 aa  267  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  41.29 
 
 
582 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2993  DNA primase  39.3 
 
 
571 aa  267  5e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  40.05 
 
 
623 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>