More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1190 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1190  DNA primase  100 
 
 
631 aa  1266    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0527  DNA primase  50.64 
 
 
578 aa  562  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  47.07 
 
 
592 aa  532  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  59.1 
 
 
576 aa  510  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2028  DNA primase  47.19 
 
 
603 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2421  DNA primase  46.62 
 
 
603 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  44.84 
 
 
645 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0887  DNA primase  45.84 
 
 
604 aa  484  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.612944  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  56.88 
 
 
565 aa  485  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2607  DNA primase  46.75 
 
 
613 aa  482  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.496345  normal  0.674189 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2216  DNA primase  46.39 
 
 
603 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3256  DNA primase  50.57 
 
 
622 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0530643 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3782  DNA primase  50.38 
 
 
622 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.18227  normal  0.0180999 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  45.24 
 
 
652 aa  474  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  42.18 
 
 
586 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3642  DNA primase  55.03 
 
 
625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3885  DNA primase  55.03 
 
 
625 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.987209  normal  0.529147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2205  DNA primase  53.16 
 
 
638 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  41.65 
 
 
586 aa  466  9.999999999999999e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4481  DNA primase  54.82 
 
 
800 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6775  DNA primase  55.87 
 
 
623 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0278611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4814  DNA primase  55.08 
 
 
636 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0338  DNA primase  55.93 
 
 
624 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1519  DNA primase  55.93 
 
 
624 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2385  DNA primase  55.93 
 
 
624 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3942  DNA primase  45.41 
 
 
630 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2821  DNA primase  56.24 
 
 
622 aa  465  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  41.05 
 
 
588 aa  463  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1712  DNA primase  55.93 
 
 
624 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2526  DNA primase  55.93 
 
 
624 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0372  DNA primase  55.93 
 
 
624 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0834  DNA primase  56.88 
 
 
624 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  42.58 
 
 
660 aa  460  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  46.5 
 
 
676 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.42 
 
 
609 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0620  DNA primase  57.48 
 
 
625 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2561  DNA primase  49.91 
 
 
598 aa  455  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5044  DNA primase  54.25 
 
 
677 aa  452  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.764772  normal  0.79995 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1763  DNA primase  44.34 
 
 
659 aa  450  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.586276  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  41.86 
 
 
655 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  43.19 
 
 
617 aa  444  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  41.77 
 
 
652 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1407  DNA primase  52.92 
 
 
674 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  48.08 
 
 
660 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.75 
 
 
651 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  40.51 
 
 
584 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  48.08 
 
 
660 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  48.08 
 
 
660 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  42.11 
 
 
638 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  40.76 
 
 
584 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.81 
 
 
660 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  43.16 
 
 
663 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  39.87 
 
 
584 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3137  DNA primase  51.02 
 
 
653 aa  434  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2484  DNA primase  51.02 
 
 
658 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2203  DNA primase  53.21 
 
 
625 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.198077  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  47.1 
 
 
577 aa  429  1e-119  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  40.84 
 
 
582 aa  429  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  40.84 
 
 
582 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  40.84 
 
 
582 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  47.82 
 
 
663 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  46.43 
 
 
578 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  40.76 
 
 
581 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  38.65 
 
 
583 aa  425  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0093  DNA primase  43.33 
 
 
653 aa  425  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.244748  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  47.71 
 
 
664 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  39.43 
 
 
585 aa  422  1e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  42.65 
 
 
614 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  40.1 
 
 
574 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  39.34 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  41.9 
 
 
574 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  39.97 
 
 
582 aa  416  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2490  putative DNA primase protein  52.49 
 
 
606 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.951822  normal  0.8529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  40.32 
 
 
579 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  41.52 
 
 
574 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  49.53 
 
 
575 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  416  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  40.96 
 
 
574 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  49.53 
 
 
574 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  415  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  41.9 
 
 
574 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  41.9 
 
 
574 aa  415  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  415  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  39.42 
 
 
581 aa  415  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  40.44 
 
 
582 aa  414  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  38.92 
 
 
581 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  38.92 
 
 
581 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  48.58 
 
 
574 aa  413  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  41.9 
 
 
574 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  38.92 
 
 
581 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1039  DNA primase  40.6 
 
 
588 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00521157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  41.58 
 
 
574 aa  415  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  38.92 
 
 
581 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  39.42 
 
 
581 aa  415  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  38.92 
 
 
581 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  50.35 
 
 
576 aa  412  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>