More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0742 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  100 
 
 		 621 aa  1289    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  38.1 
 
 		 606 aa  404  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.05 
 
 		 601 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  38.25 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.39 
 
 		 598 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  38.77 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  38.77 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  38.77 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  38.77 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  38.77 
 
 		 598 aa  362  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  38.77 
 
 		 598 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  38.48 
 
 		 598 aa  360  5e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  38.48 
 
 		 598 aa  359  7e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  38.29 
 
 		 571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  34.47 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.97 
 
 		 600 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  33.88 
 
 		 598 aa  353  5.9999999999999994e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  33.5 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  33.5 
 
 		 605 aa  352  1e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  32.58 
 
 		 637 aa  339  8e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.47 
 
 		 601 aa  336  5.999999999999999e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  41.96 
 
 		 602 aa  328  3e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  40.05 
 
 		 599 aa  323  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  39.9 
 
 		 603 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.07 
 
 		 600 aa  307  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  37.44 
 
 		 614 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  30.74 
 
 		 626 aa  297  3e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  32.3 
 
 		 613 aa  291  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  36.6 
 
 		 596 aa  290  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  31.03 
 
 		 595 aa  289  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  33.68 
 
 		 586 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  33.95 
 
 		 599 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  34.08 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  33.41 
 
 		 617 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  30.97 
 
 		 604 aa  282  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  34.17 
 
 		 587 aa  280  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 604 aa  280  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  35.29 
 
 		 684 aa  279  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.62 
 
 		 586 aa  278  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  39.73 
 
 		 656 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.33 
 
 		 651 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.68 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  36.9 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.2 
 
 		 655 aa  274  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2387  DNA primase  37.93 
 
 		 565 aa  273  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.38837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.8 
 
 		 652 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  33.65 
 
 		 686 aa  273  9e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  34.62 
 
 		 660 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  34.81 
 
 		 660 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  36.24 
 
 		 576 aa  272  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  36.7 
 
 		 660 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  37.47 
 
 		 638 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.08 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.7 
 
 		 660 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  38.96 
 
 		 660 aa  271  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  33.92 
 
 		 605 aa  271  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  36.55 
 
 		 640 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.08 
 
 		 663 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  30.77 
 
 		 609 aa  270  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  35.63 
 
 		 640 aa  270  5.9999999999999995e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.11 
 
 		 664 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  34.98 
 
 		 676 aa  270  8e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.16 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.95 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.95 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  32.16 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.95 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.95 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  33.41 
 
 		 621 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.95 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.95 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  34.15 
 
 		 573 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  36.95 
 
 		 581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  33.62 
 
 		 666 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  34.43 
 
 		 584 aa  267  4e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2323  DNA primase  36.24 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128644  hitchhiker  0.00849609 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  34.15 
 
 		 574 aa  267  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  33.71 
 
 		 575 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  34.96 
 
 		 581 aa  266  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  35.11 
 
 		 595 aa  266  1e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  33.33 
 
 		 636 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.7 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.7 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2337  DNA primase  34.6 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  34.2 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  34.6 
 
 		 583 aa  265  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1236  DNA primase  35.09 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00798045  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  33.79 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  33.79 
 
 		 574 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  37.12 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  37.22 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  36.61 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  36.61 
 
 		 581 aa  265  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  35.38 
 
 		 601 aa  265  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  36.61 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  36.61 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  36.61 
 
 		 581 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  34.01 
 
 		 574 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  33.48 
 
 		 593 aa  265  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0432  DNA primase  39.83 
 
 		 623 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.401206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>