More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16970 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  55.86 
 
 		 651 aa  680    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  54.14 
 
 		 634 aa  680    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  53.93 
 
 		 644 aa  669    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  53.13 
 
 		 642 aa  639    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  54.26 
 
 		 628 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  56.07 
 
 		 667 aa  676    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  54.93 
 
 		 656 aa  673    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  52.83 
 
 		 636 aa  662    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  100 
 
 		 658 aa  1324    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  50.23 
 
 		 652 aa  577  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  50.92 
 
 		 629 aa  574  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  48.87 
 
 		 657 aa  555  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  46.33 
 
 		 616 aa  554  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  49.01 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  47.11 
 
 		 641 aa  551  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  58.53 
 
 		 616 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  47.63 
 
 		 656 aa  547  1e-154  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  46.53 
 
 		 629 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  46.74 
 
 		 623 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  49.47 
 
 		 645 aa  545  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  46.86 
 
 		 639 aa  536  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  53.55 
 
 		 632 aa  534  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  58.35 
 
 		 627 aa  525  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  47.53 
 
 		 655 aa  522  1e-147  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  47.31 
 
 		 628 aa  521  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  45.66 
 
 		 648 aa  515  1e-144  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  45.3 
 
 		 624 aa  509  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  55.75 
 
 		 700 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  44.18 
 
 		 639 aa  503  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  46.57 
 
 		 649 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  40.23 
 
 		 699 aa  493  9.999999999999999e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  45.31 
 
 		 647 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  45.65 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  45.65 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  45.65 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  38.51 
 
 		 718 aa  481  1e-134  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  45.1 
 
 		 629 aa  476  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  43.46 
 
 		 932 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.36 
 
 		 587 aa  296  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  29.41 
 
 		 626 aa  296  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  39.92 
 
 		 587 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.92 
 
 		 583 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.03 
 
 		 582 aa  291  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  35.92 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.93 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40.39 
 
 		 587 aa  273  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40 
 
 		 619 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 604 aa  270  7e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.51 
 
 		 588 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  29.54 
 
 		 599 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  32.09 
 
 		 604 aa  267  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  37.67 
 
 		 576 aa  266  8e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  38.57 
 
 		 584 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.8 
 
 		 595 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.25 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  35.24 
 
 		 655 aa  258  3e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.64 
 
 		 663 aa  257  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  35.71 
 
 		 618 aa  256  8e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  33.51 
 
 		 663 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  34.67 
 
 		 567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  35.43 
 
 		 655 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1261  DNA primase  38.36 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  36.67 
 
 		 587 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  33.19 
 
 		 660 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  34.13 
 
 		 638 aa  250  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  29.6 
 
 		 590 aa  250  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.07 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  30.15 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  35.84 
 
 		 605 aa  248  3e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.62 
 
 		 581 aa  248  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  28.64 
 
 		 588 aa  248  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  33.19 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  33.19 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  33.19 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  33.19 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  33.19 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  33.19 
 
 		 581 aa  247  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  35.56 
 
 		 652 aa  247  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  30.14 
 
 		 613 aa  247  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  34.81 
 
 		 574 aa  247  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  34.09 
 
 		 592 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  36.98 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.63 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  31.32 
 
 		 640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  34.99 
 
 		 651 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  34.09 
 
 		 582 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  32.98 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  32.98 
 
 		 581 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  32.83 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  33.05 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  33.05 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  33.05 
 
 		 581 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  34.49 
 
 		 614 aa  243  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  33.05 
 
 		 581 aa  243  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3106  DNA primase  36.59 
 
 		 641 aa  243  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  33.05 
 
 		 582 aa  243  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  32.13 
 
 		 660 aa  242  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  33.05 
 
 		 582 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  33.05 
 
 		 582 aa  243  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  32.57 
 
 		 666 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>