More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1338 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  57.5 
 
 		 667 aa  717    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  55.11 
 
 		 658 aa  687    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  57.62 
 
 		 651 aa  719    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  62.89 
 
 		 636 aa  795    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  85.27 
 
 		 644 aa  1120    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  55.26 
 
 		 634 aa  688    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  58.32 
 
 		 656 aa  721    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  55.49 
 
 		 642 aa  666    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  100 
 
 		 628 aa  1274    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  53.4 
 
 		 629 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  53.57 
 
 		 645 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  51.19 
 
 		 656 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  49.62 
 
 		 652 aa  588  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  51.74 
 
 		 629 aa  588  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  50.79 
 
 		 629 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  50.71 
 
 		 632 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  50.55 
 
 		 616 aa  584  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  50.39 
 
 		 639 aa  573  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  51.56 
 
 		 624 aa  574  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  49.6 
 
 		 623 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  51.54 
 
 		 655 aa  565  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  50.95 
 
 		 627 aa  562  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  50.39 
 
 		 616 aa  554  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  48.82 
 
 		 641 aa  554  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  48.51 
 
 		 657 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  51.01 
 
 		 628 aa  543  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  48.45 
 
 		 648 aa  538  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  47.1 
 
 		 639 aa  533  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  59 
 
 		 700 aa  519  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  48.19 
 
 		 649 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  48.35 
 
 		 629 aa  514  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  45.32 
 
 		 699 aa  508  9.999999999999999e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  47.26 
 
 		 647 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  46.55 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  46.55 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  46.55 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  43.33 
 
 		 718 aa  478  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  46.51 
 
 		 932 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.47 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.77 
 
 		 626 aa  279  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  34.61 
 
 		 595 aa  277  4e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.95 
 
 		 582 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  36.62 
 
 		 600 aa  276  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  29.72 
 
 		 599 aa  276  7e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  35.73 
 
 		 583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  38.32 
 
 		 587 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.68 
 
 		 587 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  34.36 
 
 		 581 aa  273  9e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  37.1 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  34.36 
 
 		 581 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  34.36 
 
 		 581 aa  271  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  34.36 
 
 		 581 aa  271  4e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  34.36 
 
 		 581 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  34.36 
 
 		 581 aa  271  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  34.36 
 
 		 581 aa  271  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  34.17 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  34.17 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  40.26 
 
 		 587 aa  267  5e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3472  DNA primase  37.12 
 
 		 581 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104863  normal  0.247756 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  37.21 
 
 		 618 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.58 
 
 		 579 aa  263  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.55 
 
 		 605 aa  263  6.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.7 
 
 		 663 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.4 
 
 		 601 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 604 aa  262  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  38.76 
 
 		 626 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  39.15 
 
 		 664 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  36.44 
 
 		 666 aa  261  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  36.05 
 
 		 614 aa  261  3e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.95 
 
 		 638 aa  261  4e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  36.73 
 
 		 655 aa  260  7e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.02 
 
 		 585 aa  259  1e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  37.38 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.19 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  37.38 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  37.38 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  37.38 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.38 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  37.72 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  36.06 
 
 		 663 aa  259  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.1 
 
 		 582 aa  257  5e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  35.5 
 
 		 582 aa  257  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  36.98 
 
 		 655 aa  257  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  35.18 
 
 		 613 aa  257  6e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  39.53 
 
 		 619 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  36.57 
 
 		 584 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.96 
 
 		 584 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  36.53 
 
 		 592 aa  254  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  28.08 
 
 		 653 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  36.53 
 
 		 584 aa  254  3e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  29.98 
 
 		 604 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.09 
 
 		 652 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  35.73 
 
 		 582 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  35.73 
 
 		 582 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  35.73 
 
 		 582 aa  253  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.5 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  37.77 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  35.65 
 
 		 584 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  36.16 
 
 		 651 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.71 
 
 		 600 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>