More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3198 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  58.9 
 
 		 628 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  55.05 
 
 		 616 aa  644    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  63.97 
 
 		 616 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  53.76 
 
 		 657 aa  637    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  61.59 
 
 		 656 aa  783    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  56.96 
 
 		 624 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  57.52 
 
 		 629 aa  655    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  100 
 
 		 629 aa  1254    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  53.58 
 
 		 629 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  58.15 
 
 		 623 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  57.69 
 
 		 655 aa  662    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  65.37 
 
 		 645 aa  776    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  51.72 
 
 		 641 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  53.15 
 
 		 632 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  53.01 
 
 		 628 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  52.43 
 
 		 639 aa  617  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  53.31 
 
 		 627 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  52.05 
 
 		 639 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  51.9 
 
 		 656 aa  605  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  51.72 
 
 		 667 aa  605  1.0000000000000001e-171  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  51.39 
 
 		 644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  52.01 
 
 		 636 aa  593  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  51.45 
 
 		 651 aa  591  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  50.54 
 
 		 634 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  51.64 
 
 		 649 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  50.47 
 
 		 629 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  50.91 
 
 		 642 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  52.11 
 
 		 647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  51.94 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  51.79 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  51.94 
 
 		 640 aa  565  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  48.25 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  49.31 
 
 		 658 aa  553  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  51.11 
 
 		 652 aa  548  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  60.82 
 
 		 700 aa  540  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  48.87 
 
 		 932 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  39.97 
 
 		 699 aa  466  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  38.86 
 
 		 718 aa  460  9.999999999999999e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.02 
 
 		 626 aa  309  9e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  37.81 
 
 		 600 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.21 
 
 		 583 aa  296  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  35.75 
 
 		 587 aa  293  5e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.88 
 
 		 582 aa  292  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  34.57 
 
 		 588 aa  292  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  40.65 
 
 		 587 aa  292  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  35.85 
 
 		 626 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  40.96 
 
 		 588 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  34.54 
 
 		 618 aa  283  8.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  35.26 
 
 		 595 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  37.1 
 
 		 599 aa  278  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.79 
 
 		 605 aa  276  9e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  35.28 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1681  DNA primase  41.71 
 
 		 592 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.45 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.36 
 
 		 595 aa  270  7e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  37.06 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  39.4 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.12 
 
 		 595 aa  267  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2268  DNA primase  39 
 
 		 587 aa  266  7e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40 
 
 		 619 aa  266  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  36.77 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.77 
 
 		 598 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.33 
 
 		 604 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.46 
 
 		 655 aa  264  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.74 
 
 		 593 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  36.65 
 
 		 666 aa  263  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.29 
 
 		 663 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  35.31 
 
 		 613 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  39.95 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.29 
 
 		 664 aa  261  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  40.63 
 
 		 599 aa  260  5.0000000000000005e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  34.04 
 
 		 632 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.72 
 
 		 638 aa  259  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  34.58 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  37.61 
 
 		 652 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.46 
 
 		 663 aa  256  7e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  39.16 
 
 		 642 aa  256  9e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.84 
 
 		 651 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  38.32 
 
 		 660 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  41.33 
 
 		 599 aa  255  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  40.63 
 
 		 598 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  39.02 
 
 		 601 aa  253  5.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  41.22 
 
 		 614 aa  253  7e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  37.87 
 
 		 660 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  36.96 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  37.87 
 
 		 660 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  34.04 
 
 		 640 aa  251  3e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  33.59 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  30.74 
 
 		 578 aa  251  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  37.24 
 
 		 660 aa  251  4e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  37.85 
 
 		 579 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  37.87 
 
 		 660 aa  250  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>