More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0276 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  100 
 
 		 660 aa  1363    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  45.96 
 
 		 653 aa  585  1e-166  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  45.37 
 
 		 674 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  41.82 
 
 		 704 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  43.33 
 
 		 640 aa  546  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  51.68 
 
 		 656 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  43.89 
 
 		 703 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  49.6 
 
 		 657 aa  510  1e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  40.5 
 
 		 662 aa  510  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  40.72 
 
 		 673 aa  488  1e-136  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  35.2 
 
 		 619 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  40.05 
 
 		 595 aa  326  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.45 
 
 		 588 aa  323  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.68 
 
 		 599 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  41.31 
 
 		 636 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  36.03 
 
 		 587 aa  312  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  39.03 
 
 		 587 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.18 
 
 		 613 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  40.43 
 
 		 660 aa  306  8.000000000000001e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  37.58 
 
 		 605 aa  306  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  38 
 
 		 632 aa  304  4.0000000000000003e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  39.04 
 
 		 630 aa  303  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.21 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  39.73 
 
 		 632 aa  301  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  35.92 
 
 		 582 aa  300  6e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  42.25 
 
 		 599 aa  299  1e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  36.09 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.18 
 
 		 604 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  37.19 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  39.02 
 
 		 604 aa  297  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.46 
 
 		 600 aa  297  4e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  37.88 
 
 		 544 aa  297  5e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  38.94 
 
 		 595 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  38.71 
 
 		 595 aa  294  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  38.52 
 
 		 633 aa  293  5e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.18 
 
 		 598 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  39.19 
 
 		 631 aa  291  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  35.51 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  36.53 
 
 		 593 aa  290  5.0000000000000004e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  36.98 
 
 		 575 aa  290  6e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  290  7e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.94 
 
 		 571 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  41.85 
 
 		 611 aa  289  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  44.19 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  35.94 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.09 
 
 		 600 aa  289  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  36.19 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  34.75 
 
 		 614 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  39.53 
 
 		 638 aa  287  5e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  35.55 
 
 		 598 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  41.46 
 
 		 609 aa  287  5.999999999999999e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  36.4 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.14 
 
 		 584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1605  DNA primase  37.24 
 
 		 676 aa  286  1.0000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.93 
 
 		 663 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  41.05 
 
 		 574 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 604 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  34.49 
 
 		 663 aa  283  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  38.93 
 
 		 664 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  37.53 
 
 		 617 aa  282  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  41.3 
 
 		 684 aa  281  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  34.92 
 
 		 598 aa  281  4e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  40.5 
 
 		 574 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  40.5 
 
 		 574 aa  280  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  35.43 
 
 		 605 aa  280  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  35.43 
 
 		 605 aa  280  7e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  40.67 
 
 		 574 aa  280  9e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  36.81 
 
 		 626 aa  280  9e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  39.29 
 
 		 578 aa  280  9e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  40.5 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.13 
 
 		 651 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  40.67 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  38.76 
 
 		 655 aa  279  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  40.67 
 
 		 574 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  39.18 
 
 		 576 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3096  DNA primase  41.18 
 
 		 660 aa  279  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  40.5 
 
 		 574 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  40.67 
 
 		 574 aa  278  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  40.39 
 
 		 574 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  38.62 
 
 		 652 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  39.78 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  40.17 
 
 		 601 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  35.56 
 
 		 585 aa  274  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2309  DNA primase  34.07 
 
 		 577 aa  273  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0635  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000955759  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0302  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000195537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0554  DNA primase  37.44 
 
 		 582 aa  273  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000322663  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  39.29 
 
 		 660 aa  273  9e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2282  DNA primase  34.07 
 
 		 578 aa  273  9e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  40.32 
 
 		 586 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  39.29 
 
 		 660 aa  272  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4299  DNA primase  36.84 
 
 		 582 aa  272  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.136989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  36.61 
 
 		 599 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  39.29 
 
 		 660 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  39.29 
 
 		 660 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>