More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3425 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  61.38 
 
 		 616 aa  734    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3425  DNA primase  100 
 
 		 632 aa  1275    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.236565 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3198  DNA primase  53.94 
 
 		 629 aa  644    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0946512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2351  DNA primase  55.06 
 
 		 616 aa  647    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13800  DNA primase  55.09 
 
 		 657 aa  656    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0288236  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1675  DNA primase  59.24 
 
 		 628 aa  659    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1275  DNA primase  56.43 
 
 		 629 aa  679    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3802  DNA primase  93.62 
 
 		 627 aa  1116    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1187  DNA primase  55.71 
 
 		 645 aa  638    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2128  DNA primase  54.21 
 
 		 624 aa  622  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2739  DNA primase  51.01 
 
 		 641 aa  608  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0806  DNA primase  54.07 
 
 		 655 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0702707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3142  DNA primase  51.41 
 
 		 639 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12367  DNA primase  50.39 
 
 		 639 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0866  DNA primase  49.68 
 
 		 656 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1788  DNA primase  50.67 
 
 		 667 aa  593  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0286526  normal  0.367245 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0761  DNA primase  50.16 
 
 		 623 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1338  DNA primase  51.25 
 
 		 628 aa  588  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.433596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3814  DNA primase  51.72 
 
 		 649 aa  584  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280828  normal  0.471338 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1282  DNA primase  51.98 
 
 		 629 aa  582  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1374  DNA primase  49 
 
 		 644 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000143214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06330  DNA primase  50.7 
 
 		 636 aa  573  1.0000000000000001e-162  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3453  DNA primase  52.43 
 
 		 640 aa  570  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.293123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3442  DNA primase  52.27 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3505  DNA primase  52.27 
 
 		 640 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2722  DNA primase  51.72 
 
 		 647 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2169  DNA primase  51.15 
 
 		 651 aa  565  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.403807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13980  DNA primase  48.48 
 
 		 656 aa  558  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1932  DNA primase  49.92 
 
 		 648 aa  552  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0456378  hitchhiker  0.00240757 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1522  DNA primase  48.75 
 
 		 634 aa  552  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0736351 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2156  DNA primase  48.37 
 
 		 642 aa  541  9.999999999999999e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16970  DNA primase  47.37 
 
 		 658 aa  537  1e-151  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.522082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7022  DNA primase  59.41 
 
 		 700 aa  524  1e-147  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210771  normal  0.1359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3361  DNA primase  47.32 
 
 		 629 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0761003  normal  0.0199865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11920  DNA primase  45.54 
 
 		 652 aa  500  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.042879  normal  0.210825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1947  DNA primase  50 
 
 		 932 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0904  DNA primase  42.01 
 
 		 699 aa  452  1e-125  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1050  DNA primase  41.35 
 
 		 718 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  41.44 
 
 		 587 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  40.45 
 
 		 587 aa  312  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  41 
 
 		 588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  35.91 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  37.36 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  34.25 
 
 		 600 aa  287  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.17 
 
 		 582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  34.48 
 
 		 601 aa  283  7.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  39.52 
 
 		 614 aa  281  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  34.83 
 
 		 626 aa  281  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 604 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  39.84 
 
 		 617 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  38.08 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  39.49 
 
 		 605 aa  277  3e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.67 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  37.9 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  39.55 
 
 		 638 aa  273  7e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  37.64 
 
 		 655 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3470  DNA primase  35.1 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00422758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3400  DNA primase  35.1 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0281118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  33.5 
 
 		 592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3464  DNA primase  35.1 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0547765  hitchhiker  0.00925719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3396  DNA primase  35.1 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000108195  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09410  DNA primase, catalytic core  34.6 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.967138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3566  DNA primase  37.3 
 
 		 581 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0608711  normal  0.272103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  37.2 
 
 		 651 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  37.64 
 
 		 664 aa  270  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  36.98 
 
 		 652 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  32.92 
 
 		 666 aa  268  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  37.1 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  38.9 
 
 		 694 aa  267  5e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  33.62 
 
 		 595 aa  267  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  33.53 
 
 		 571 aa  266  8e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  30.15 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  29.87 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  29.87 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  30.15 
 
 		 598 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  29.87 
 
 		 598 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.14 
 
 		 593 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  38.12 
 
 		 576 aa  264  3e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  38.17 
 
 		 587 aa  265  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  35.75 
 
 		 614 aa  264  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  36.87 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  36.87 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4378  DNA primase  36.87 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000022434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  36.87 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  36.87 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  36.87 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  34.55 
 
 		 598 aa  263  6.999999999999999e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  29.71 
 
 		 598 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  37.09 
 
 		 660 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  34.9 
 
 		 600 aa  262  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0633  DNA primase  36.64 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000014553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3246  DNA primase  36.64 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  34.68 
 
 		 655 aa  261  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  36.71 
 
 		 660 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  35.98 
 
 		 604 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  37.85 
 
 		 584 aa  261  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1295  DNA primase  34.65 
 
 		 686 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.830099  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  29.58 
 
 		 598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  29.58 
 
 		 598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.19 
 
 		 613 aa  260  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>